34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1242 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
251 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  68.05 
 
 
252 aa  345  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  62.24 
 
 
266 aa  322  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  63.51 
 
 
230 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  50.78 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  42.61 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  38.87 
 
 
258 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  45.83 
 
 
727 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  39.73 
 
 
239 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  44.33 
 
 
218 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  39.71 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  36.45 
 
 
627 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  34.35 
 
 
1880 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.95 
 
 
831 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  43.87 
 
 
165 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  36.15 
 
 
233 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  36.84 
 
 
230 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  33.06 
 
 
419 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  37.27 
 
 
238 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  35.9 
 
 
571 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  31.87 
 
 
552 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  32.82 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  30.16 
 
 
865 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  36.36 
 
 
161 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  28.41 
 
 
551 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  31.66 
 
 
491 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  32.62 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  27.97 
 
 
552 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  27.59 
 
 
552 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  26.1 
 
 
546 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  28.51 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  27.73 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  43.01 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2625  hypothetical protein  28.08 
 
 
469 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>