32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3046 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  94.2 
 
 		 552 aa  1093    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  100 
 
 		 552 aa  1152    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  62.55 
 
 		 551 aa  723    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  63.67 
 
 		 546 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  46.02 
 
 		 865 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  27.91 
 
 		 340 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.88 
 
 		 831 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  28.85 
 
 		 285 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  25.67 
 
 		 266 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  26.79 
 
 		 230 aa  94.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  27.91 
 
 		 239 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  28.41 
 
 		 627 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  30.04 
 
 		 252 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  27.59 
 
 		 251 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  27.73 
 
 		 1880 aa  87.4  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  28.9 
 
 		 727 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  28.78 
 
 		 571 aa  84  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  27.27 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  31.44 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  33.77 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  24.63 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  25.13 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  25.1 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  22.79 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  22.83 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  27.13 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  25.57 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  31.21 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  36.59 
 
 		 245 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  24.8 
 
 		 238 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  29.81 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>