33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29260 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  46.05 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  47.51 
 
 
238 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  39.81 
 
 
252 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  38.53 
 
 
340 aa  141  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  38.6 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  36.84 
 
 
251 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 
285 aa  138  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  38.03 
 
 
727 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
266 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  39.71 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  31.22 
 
 
258 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  39.34 
 
 
627 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.03 
 
 
266 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  35.05 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  34.42 
 
 
1880 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  42.14 
 
 
165 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.08 
 
 
831 aa  101  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  33.64 
 
 
571 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  32.81 
 
 
277 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  34.56 
 
 
419 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  25.83 
 
 
491 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  32.57 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  24.71 
 
 
865 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  27.08 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  36.55 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  24.63 
 
 
552 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  23.69 
 
 
546 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  25 
 
 
552 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  25.37 
 
 
551 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  29.61 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  27.22 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  28.89 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>