29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4061 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4061  hypothetical protein  100 
 
 		 1351 aa  2762    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0111461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  37.5 
 
 		 917 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  34.57 
 
 		 2990 aa  348  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 892 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  34.03 
 
 		 941 aa  337  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  31.21 
 
 		 940 aa  328  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  29.62 
 
 		 1150 aa  273  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  30.88 
 
 		 1168 aa  261  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  28.61 
 
 		 914 aa  193  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  29.7 
 
 		 916 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  28.82 
 
 		 940 aa  170  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  26.45 
 
 		 813 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.38 
 
 		 1519 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1547 aa  57  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.67 
 
 		 1266 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  31.18 
 
 		 5517 aa  53.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  34.17 
 
 		 5203 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  23.18 
 
 		 5544 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  48.08 
 
 		 1153 aa  50.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  31.47 
 
 		 2890 aa  50.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  48.08 
 
 		 1153 aa  50.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  40.74 
 
 		 965 aa  49.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  40.74 
 
 		 965 aa  49.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  48.15 
 
 		 892 aa  49.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  39.47 
 
 		 733 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  48.08 
 
 		 436 aa  48.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  39.76 
 
 		 5166 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  28.42 
 
 		 282 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.72 
 
 		 991 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>