33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0506 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  100 
 
 
941 aa  1891    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  82.04 
 
 
940 aa  1556    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  37.59 
 
 
2990 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4061  hypothetical protein  31.57 
 
 
1351 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0111461  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  32.6 
 
 
917 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  32.58 
 
 
1150 aa  277  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  31.34 
 
 
892 aa  277  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  33.41 
 
 
1168 aa  267  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  29.02 
 
 
916 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  29.18 
 
 
940 aa  190  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  28.93 
 
 
914 aa  188  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  28.25 
 
 
813 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  32.78 
 
 
5517 aa  124  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  34.28 
 
 
5166 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  31.45 
 
 
5203 aa  109  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  40.52 
 
 
1118 aa  77  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  33.9 
 
 
586 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.33 
 
 
1519 aa  71.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  40.57 
 
 
807 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  33.55 
 
 
282 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  28.97 
 
 
3324 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  50 
 
 
1337 aa  52  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  50 
 
 
1337 aa  52  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  39.42 
 
 
1134 aa  51.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  50 
 
 
666 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  62.5 
 
 
5544 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  41.38 
 
 
1153 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  41.38 
 
 
1153 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0979  metallophosphoesterase  38 
 
 
525 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00136331  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  41.07 
 
 
965 aa  45.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  41.07 
 
 
965 aa  45.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  39.66 
 
 
1263 aa  45.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  46 
 
 
892 aa  45.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>