64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4324 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 436 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  42.38 
 
 		 2047 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  38.93 
 
 		 3373 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  47.11 
 
 		 666 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  41.03 
 
 		 1243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  32.73 
 
 		 1337 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  39.64 
 
 		 5203 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  32.73 
 
 		 1337 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  30.85 
 
 		 1263 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  29.43 
 
 		 5544 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  33.2 
 
 		 2990 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  31.62 
 
 		 1153 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  31.62 
 
 		 1153 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  32.11 
 
 		 2604 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  32.33 
 
 		 892 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  28.99 
 
 		 965 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  28.99 
 
 		 965 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.6 
 
 		 3324 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1727 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  30.91 
 
 		 5517 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  32.39 
 
 		 5166 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  29.52 
 
 		 733 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  28.4 
 
 		 1531 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  32.63 
 
 		 2656 aa  67.4  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  39.33 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  39.33 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  30.04 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  28 
 
 		 733 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  29.11 
 
 		 2876 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  28.14 
 
 		 1150 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  27.09 
 
 		 2890 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  33.64 
 
 		 1519 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  31.46 
 
 		 2112 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  30.8 
 
 		 870 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.58 
 
 		 753 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  33.53 
 
 		 983 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  39.33 
 
 		 130 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  41.94 
 
 		 914 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  32.34 
 
 		 727 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  42.62 
 
 		 916 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  27.04 
 
 		 1168 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  40.98 
 
 		 940 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.92 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  32.5 
 
 		 917 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  25.99 
 
 		 3392 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  36.99 
 
 		 969 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  36.99 
 
 		 969 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.99 
 
 		 971 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  40.43 
 
 		 3634 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.71 
 
 		 3190 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  28.39 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 		 3921 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.42 
 
 		 3210 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.41 
 
 		 3486 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  48 
 
 		 940 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  35.16 
 
 		 813 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1665 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 850 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.11 
 
 		 1112 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  29.1 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  25.29 
 
 		 3333 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  27.16 
 
 		 3242 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  38.36 
 
 		 1508 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>