45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0184 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  100 
 
 		 917 aa  1864    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4061  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0111461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  32.6 
 
 		 941 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  32.2 
 
 		 940 aa  333  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  35.74 
 
 		 2990 aa  333  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  33.47 
 
 		 892 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  31.8 
 
 		 1168 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  31.22 
 
 		 1150 aa  264  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  27.33 
 
 		 916 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  27.76 
 
 		 914 aa  162  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  26.93 
 
 		 940 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  25.96 
 
 		 813 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.43 
 
 		 1519 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  36.91 
 
 		 5544 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  39.8 
 
 		 1337 aa  60.1  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  39.8 
 
 		 1337 aa  60.1  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  50 
 
 		 5517 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  37.17 
 
 		 965 aa  56.2  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  37.17 
 
 		 965 aa  56.2  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  46.03 
 
 		 1153 aa  55.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  46.03 
 
 		 1153 aa  55.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  50.77 
 
 		 3373 aa  55.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  31.66 
 
 		 733 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  38.57 
 
 		 436 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  38.57 
 
 		 436 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  43.16 
 
 		 5203 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 3324 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  41.07 
 
 		 282 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  45.9 
 
 		 1727 aa  52.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  45 
 
 		 892 aa  51.6  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  39.44 
 
 		 440 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  41.89 
 
 		 5166 aa  52  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  33.12 
 
 		 2604 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  32.5 
 
 		 436 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  41.18 
 
 		 2047 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  31.11 
 
 		 2876 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  40.74 
 
 		 8918 aa  48.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 502 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  42.67 
 
 		 2890 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  44 
 
 		 666 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  39.71 
 
 		 1263 aa  46.2  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  37.33 
 
 		 2112 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  42.42 
 
 		 1984 aa  45.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  42.42 
 
 		 2000 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1757 aa  45.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>