32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3630 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  100 
 
 
940 aa  1891    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  82.04 
 
 
941 aa  1558    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  36.85 
 
 
2990 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  32.2 
 
 
917 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4061  hypothetical protein  31.21 
 
 
1351 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0111461  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  31.51 
 
 
892 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  31.98 
 
 
1150 aa  282  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  33.81 
 
 
1168 aa  271  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  27.99 
 
 
916 aa  194  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  28.64 
 
 
940 aa  185  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  29.87 
 
 
914 aa  184  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  32.78 
 
 
5517 aa  128  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  34.53 
 
 
5203 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  34.75 
 
 
5166 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  39.31 
 
 
813 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  37.29 
 
 
586 aa  81.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  42.02 
 
 
1118 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  23.98 
 
 
1519 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  41.07 
 
 
807 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  37.04 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  28.17 
 
 
3324 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  37.5 
 
 
1134 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  34.17 
 
 
1337 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  34.17 
 
 
1337 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  62.5 
 
 
5544 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35 
 
 
900 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  41.38 
 
 
1153 aa  48.5  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  41.38 
 
 
1153 aa  48.5  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  48 
 
 
666 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  30.97 
 
 
2876 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  29.21 
 
 
2604 aa  45.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  48 
 
 
436 aa  44.3  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>