27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0186 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  37.04 
 
 
940 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  39.25 
 
 
1150 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  33.55 
 
 
941 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  38.46 
 
 
1168 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  42.2 
 
 
917 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  35.96 
 
 
130 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  40.86 
 
 
2876 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  45.95 
 
 
5517 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  32.53 
 
 
2990 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4061  hypothetical protein  33.09 
 
 
1351 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0111461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  36.36 
 
 
2890 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.45 
 
 
502 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  33.96 
 
 
1153 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  33.96 
 
 
1153 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  40 
 
 
3373 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  39.24 
 
 
733 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  31.78 
 
 
1337 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  31.78 
 
 
1337 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  38.55 
 
 
2112 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  41.77 
 
 
5166 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  34.04 
 
 
2047 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  34.62 
 
 
436 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  34.62 
 
 
436 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  39.71 
 
 
965 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  39.71 
 
 
965 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  37.93 
 
 
5203 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>