42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0155 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 502 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 5544 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  37.98 
 
 		 3373 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  39.51 
 
 		 2047 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  34.48 
 
 		 892 aa  57  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  34.02 
 
 		 1153 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  29.85 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  31.37 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  34.02 
 
 		 1153 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  36.76 
 
 		 1337 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  36.76 
 
 		 1337 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  38.64 
 
 		 5203 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 1168 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  35.71 
 
 		 965 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  35.71 
 
 		 965 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.58 
 
 		 3324 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  40.79 
 
 		 2604 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  38.64 
 
 		 1263 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  33.67 
 
 		 2112 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  36.92 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  36.92 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  39.71 
 
 		 1727 aa  50.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  35.62 
 
 		 2990 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  36.92 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  29.66 
 
 		 733 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  39.13 
 
 		 1150 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  39.39 
 
 		 666 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  37.89 
 
 		 5166 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  40.32 
 
 		 914 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  32.65 
 
 		 282 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  39.47 
 
 		 130 aa  47  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34 
 
 		 1667 aa  47  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 917 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  31.86 
 
 		 2876 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  46.15 
 
 		 1243 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  31.02 
 
 		 3634 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  38.81 
 
 		 5517 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1537 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  38.16 
 
 		 1519 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  37.66 
 
 		 2656 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  35.82 
 
 		 916 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>