18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2625 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  100 
 
 
2311 aa  4613    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4319  hypothetical protein  32.46 
 
 
1872 aa  490  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2059  hypothetical protein  23.43 
 
 
2481 aa  121  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  33.67 
 
 
1362 aa  85.9  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.56 
 
 
2668 aa  83.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  33.68 
 
 
255 aa  74.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  32.4 
 
 
262 aa  70.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.81 
 
 
2105 aa  60.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3422  FHA domain-containing protein  30.39 
 
 
462 aa  56.2  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  28.24 
 
 
221 aa  56.2  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4280  hypothetical protein  26.4 
 
 
251 aa  52  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000396864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3370  hypothetical protein  25.41 
 
 
256 aa  50.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.0308519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  31.86 
 
 
1260 aa  50.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1616  hypothetical protein  28.43 
 
 
478 aa  50.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0937959  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3372  hypothetical protein  25.41 
 
 
256 aa  49.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  28.99 
 
 
667 aa  47.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2772  hypothetical protein  20 
 
 
1460 aa  47.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00073265  decreased coverage  0.0000304367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2875  hypothetical protein  24.34 
 
 
935 aa  46.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00707344  normal  0.0310527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>