18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0280 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0280  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  57.45 
 
 		 875 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  43.84 
 
 		 676 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2420  blue (type1) copper domain-containing protein  51.04 
 
 		 159 aa  104  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1285  blue (type 1) copper domain protein  41.18 
 
 		 160 aa  97.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00926842  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 		 1171 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.65 
 
 		 1306 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  36.96 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  34.15 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  26.28 
 
 		 722 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 		 628 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2016  hypothetical protein  31.76 
 
 		 394 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000485133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  28.23 
 
 		 669 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  25.44 
 
 		 673 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  28.18 
 
 		 114 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.19 
 
 		 1390 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.97 
 
 		 1180 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  32.41 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>