43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4813 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
778 aa  1544    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  32.55 
 
 
942 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.5 
 
 
842 aa  291  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  32.82 
 
 
935 aa  283  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.04 
 
 
707 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  31.84 
 
 
1298 aa  270  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  30.97 
 
 
911 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  30.16 
 
 
1904 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  30.23 
 
 
978 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  30.3 
 
 
925 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  30.82 
 
 
906 aa  248  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  30.13 
 
 
913 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  32.49 
 
 
1288 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  29.18 
 
 
873 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  29.31 
 
 
934 aa  227  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  29.93 
 
 
836 aa  211  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01542  oligo-xyloglucan specific cellobiohydrolase (Eurofung)  28.08 
 
 
810 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.75 
 
 
681 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  28.05 
 
 
1048 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.38 
 
 
652 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  27.27 
 
 
1043 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.24 
 
 
630 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.9 
 
 
1041 aa  55.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  26.39 
 
 
1090 aa  54.3  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  29.88 
 
 
1117 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.97 
 
 
1021 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  21.88 
 
 
1147 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.2 
 
 
345 aa  51.2  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.2 
 
 
345 aa  51.2  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25.68 
 
 
1032 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.83 
 
 
999 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24 
 
 
357 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  25.81 
 
 
362 aa  48.5  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.16 
 
 
1063 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.66 
 
 
694 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.49 
 
 
757 aa  46.6  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.95 
 
 
1044 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  23.64 
 
 
357 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  23.64 
 
 
357 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
393 aa  45.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  22.53 
 
 
1084 aa  44.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  27.75 
 
 
1220 aa  44.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  33.98 
 
 
367 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>