105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3522 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  732    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  64.4 
 
 
368 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  61.01 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  61.26 
 
 
382 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  64.11 
 
 
365 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  62.08 
 
 
385 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  60.99 
 
 
382 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  61.78 
 
 
382 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  60.47 
 
 
404 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  60.47 
 
 
404 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  58.51 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  58.51 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  60.57 
 
 
382 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  59.67 
 
 
371 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.6 
 
 
361 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  59.38 
 
 
363 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.05 
 
 
381 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  59.13 
 
 
365 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  61.49 
 
 
369 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  61.88 
 
 
371 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  61.6 
 
 
367 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  55.07 
 
 
377 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.37 
 
 
393 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  38.42 
 
 
362 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.91 
 
 
359 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  37.09 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.57 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.16 
 
 
371 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  35.83 
 
 
362 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.28 
 
 
361 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  34.25 
 
 
373 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  33.88 
 
 
371 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.15 
 
 
378 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  30.81 
 
 
371 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.15 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.52 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  33.24 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  31.37 
 
 
368 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.98 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  24.39 
 
 
681 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  28.81 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  21.84 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.66 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.66 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  22.45 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24.14 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.63 
 
 
652 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  21.81 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  21.81 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  22.71 
 
 
608 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.96 
 
 
931 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  23.28 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  21.66 
 
 
370 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.49 
 
 
909 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.6 
 
 
630 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  26.37 
 
 
1060 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  24.78 
 
 
409 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  25.79 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.7 
 
 
707 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.88 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.53 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 
1044 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.25 
 
 
361 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  23.31 
 
 
357 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  23.71 
 
 
347 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  24.06 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.02 
 
 
780 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  22.57 
 
 
357 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.57 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.85 
 
 
1063 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.66 
 
 
1021 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  23.31 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.31 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  24.15 
 
 
1048 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.96 
 
 
1078 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.52 
 
 
597 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  23.31 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  22.57 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.69 
 
 
694 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.34 
 
 
1041 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  29.25 
 
 
1298 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  25.17 
 
 
557 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.89 
 
 
1060 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  27.4 
 
 
1043 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  23.46 
 
 
1054 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.59 
 
 
842 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  21.67 
 
 
1084 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.38 
 
 
757 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  24 
 
 
934 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.34 
 
 
999 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>