83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4876 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 367 aa  735    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.53 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  53.23 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  51.21 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  50.13 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  50.13 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  47.97 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  40.85 
 
 		 371 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  40.11 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.73 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  37.47 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  39.01 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  37.94 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.94 
 
 		 393 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  34.91 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  35.16 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  32.91 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  34.46 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  33.67 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  33.42 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  36.8 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  34.66 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  33.42 
 
 		 385 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  33.78 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  33.42 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  33.17 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  36.87 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.68 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.42 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.37 
 
 		 361 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  33.17 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  33.17 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  31.53 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  31.53 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  34.15 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  34.66 
 
 		 363 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  33.6 
 
 		 377 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.76 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  25.61 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.96 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  26.3 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  26.3 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  26.06 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.45 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.96 
 
 		 652 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  22.75 
 
 		 681 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  24.4 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.12 
 
 		 630 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  23.81 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  23.67 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  24.53 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  24.04 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1063 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  23.44 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.44 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.46 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.56 
 
 		 1041 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25.93 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  23.53 
 
 		 608 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  26.36 
 
 		 361 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 931 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  27.54 
 
 		 952 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1082 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1021 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  25.47 
 
 		 1083 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1044 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1090 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  23.51 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1078 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  23.51 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  23.51 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1220 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  23.49 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  23.49 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  23.49 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.91 
 
 		 912 aa  43.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.52 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  23.49 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>