44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4222 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  100 
 
 		 1233 aa  2481    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  38.58 
 
 		 938 aa  354  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  31.01 
 
 		 671 aa  173  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  32.53 
 
 		 462 aa  172  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  32.59 
 
 		 1056 aa  166  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1121 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  31.42 
 
 		 867 aa  133  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.95 
 
 		 746 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46087  predicted protein  29.9 
 
 		 907 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  30.18 
 
 		 953 aa  105  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3101  putative serine protease protein  26.52 
 
 		 664 aa  102  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.672072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4257  fibronectin type III domain-containing protein  30.04 
 
 		 634 aa  101  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.735386  normal  0.703985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2604  Fibronectin type III domain protein  28.12 
 
 		 716 aa  94.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248661  hitchhiker  0.00161973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1321 aa  86.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2169  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.04 
 
 		 818 aa  80.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03876  putative serine protease protein  26.08 
 
 		 663 aa  76.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  30.85 
 
 		 1124 aa  58.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6273  Hyalin  47.3 
 
 		 603 aa  52.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  41.1 
 
 		 803 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.1 
 
 		 807 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  43.94 
 
 		 1315 aa  50.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 868 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  35.24 
 
 		 644 aa  50.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  41.07 
 
 		 789 aa  49.3  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  39.73 
 
 		 807 aa  49.3  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.1 
 
 		 823 aa  48.9  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.73 
 
 		 805 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 818 aa  47.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4620  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.88 
 
 		 421 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0849966  hitchhiker  0.0030964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.7 
 
 		 1251 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.73 
 
 		 805 aa  47.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  39.73 
 
 		 677 aa  47.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.78 
 
 		 819 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 		 882 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.78 
 
 		 819 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  39.73 
 
 		 794 aa  47  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.78 
 
 		 819 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.78 
 
 		 819 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.73 
 
 		 809 aa  47.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.48 
 
 		 797 aa  47  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.04 
 
 		 699 aa  46.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  45.16 
 
 		 514 aa  46.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.23 
 
 		 612 aa  45.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  39.25 
 
 		 410 aa  45.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>