109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5141 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  100 
 
 
938 aa  1863    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  39.12 
 
 
1233 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  32.39 
 
 
1056 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  29.49 
 
 
671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  30.03 
 
 
867 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46087  predicted protein  32.81 
 
 
907 aa  150  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
1121 aa  150  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  30.26 
 
 
462 aa  150  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.54 
 
 
746 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3101  putative serine protease protein  29.13 
 
 
664 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.672072  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  30.56 
 
 
953 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_003296  RS03876  putative serine protease protein  26.75 
 
 
663 aa  98.6  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2604  Fibronectin type III domain protein  28.77 
 
 
716 aa  90.5  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248661  hitchhiker  0.00161973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4257  fibronectin type III domain-containing protein  29.39 
 
 
634 aa  90.1  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.735386  normal  0.703985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.36 
 
 
807 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2169  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 
818 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 
803 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.61 
 
 
835 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.35 
 
 
835 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
823 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  27.39 
 
 
807 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 
699 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.05 
 
 
597 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  26.24 
 
 
818 aa  65.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  47.83 
 
 
794 aa  64.7  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
3299 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  50 
 
 
677 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
3419 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.35 
 
 
835 aa  62  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 
805 aa  61.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.87 
 
 
819 aa  61.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 
805 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 
809 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 
819 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 
819 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 
819 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 
836 aa  60.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  25.74 
 
 
1151 aa  58.2  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  34.88 
 
 
644 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.1 
 
 
509 aa  56.6  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  45.76 
 
 
789 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  40.26 
 
 
789 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  26.98 
 
 
840 aa  55.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.94 
 
 
818 aa  55.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.61 
 
 
1052 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.71 
 
 
557 aa  54.7  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46872  predicted protein  35.23 
 
 
670 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.06 
 
 
633 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  33.33 
 
 
644 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  42.86 
 
 
803 aa  52.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
429 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3162  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.78 
 
 
543 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177636  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  43.59 
 
 
514 aa  52  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 
775 aa  51.2  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  38.46 
 
 
526 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12681  hypothetical protein  41.18 
 
 
675 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.222575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.62 
 
 
605 aa  50.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2720  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.04 
 
 
613 aa  50.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000639683  hitchhiker  0.000730662 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.16 
 
 
797 aa  50.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.19 
 
 
3535 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.4 
 
 
3537 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.64 
 
 
627 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.52 
 
 
3298 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 
802 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
1054 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0715  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.74 
 
 
541 aa  48.9  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
636 aa  48.9  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3547  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.21 
 
 
556 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39 
 
 
519 aa  48.9  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.07 
 
 
807 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 
1336 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4557  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.59 
 
 
421 aa  48.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 
612 aa  48.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.79 
 
 
1158 aa  47.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.98 
 
 
627 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.92 
 
 
682 aa  47.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2634  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  46.77 
 
 
710 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  34.44 
 
 
1406 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4009  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.83 
 
 
662 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0614  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 
511 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  41.1 
 
 
965 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
627 aa  47  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  41.67 
 
 
909 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  34.44 
 
 
1407 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  36.97 
 
 
1109 aa  47  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 
640 aa  47  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  38.03 
 
 
1028 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 
587 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 
587 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.45 
 
 
608 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.81 
 
 
607 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  32.53 
 
 
1004 aa  46.2  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.19 
 
 
576 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.28 
 
 
1125 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.14 
 
 
1205 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0753  alkaline serine protease  33.96 
 
 
609 aa  45.8  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 
429 aa  45.8  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3716  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.76 
 
 
524 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338967 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
452 aa  45.8  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 
669 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>