89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03876 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03876  putative serine protease protein  100 
 
 		 663 aa  1342    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3101  putative serine protease protein  78.39 
 
 		 664 aa  1048    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.672072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46087  predicted protein  30.2 
 
 		 907 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4257  fibronectin type III domain-containing protein  29.53 
 
 		 634 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.735386  normal  0.703985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  28.44 
 
 		 1056 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  28.63 
 
 		 953 aa  127  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1121 aa  107  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  25.41 
 
 		 671 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  26.01 
 
 		 867 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2604  Fibronectin type III domain protein  30.59 
 
 		 716 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248661  hitchhiker  0.00161973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.4 
 
 		 746 aa  94.4  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  26.51 
 
 		 938 aa  87  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  22.2 
 
 		 462 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1233 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  48.53 
 
 		 794 aa  60.8  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46872  predicted protein  46.48 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.66 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3162  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.11 
 
 		 543 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.79 
 
 		 682 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  45.59 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  46.88 
 
 		 677 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.69 
 
 		 557 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  45 
 
 		 807 aa  54.3  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  44.12 
 
 		 526 aa  54.3  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  40.58 
 
 		 644 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2634  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.29 
 
 		 710 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  41.67 
 
 		 1033 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  34.19 
 
 		 789 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.76 
 
 		 1052 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.26 
 
 		 819 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.3 
 
 		 640 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45 
 
 		 823 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.26 
 
 		 819 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.26 
 
 		 819 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.26 
 
 		 819 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 		 805 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 		 809 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  42.37 
 
 		 1038 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 		 805 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  43.06 
 
 		 533 aa  50.8  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  42.37 
 
 		 1055 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  38.1 
 
 		 1004 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  31.09 
 
 		 1028 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45 
 
 		 803 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  42.65 
 
 		 803 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4620  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 		 421 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0849966  hitchhiker  0.0030964 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.29 
 
 		 882 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  35.4 
 
 		 1312 aa  49.7  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.1 
 
 		 690 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.28 
 
 		 520 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 710 aa  48.5  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  40.32 
 
 		 789 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.91 
 
 		 852 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.13 
 
 		 1125 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 453 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.19 
 
 		 818 aa  48.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 868 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.06 
 
 		 449 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 		 807 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.15 
 
 		 444 aa  47.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 452 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.25 
 
 		 710 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2404  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 		 925 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0146269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.112801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.23 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1205 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 807 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.68 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.48 
 
 		 392 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.81 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4557  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.09 
 
 		 421 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.81 
 
 		 1565 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2745  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 		 521 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000278512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  34.21 
 
 		 576 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 		 1054 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.91 
 
 		 724 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.08 
 
 		 447 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2720  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.68 
 
 		 613 aa  45.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000639683  hitchhiker  0.000730662 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12681  hypothetical protein  41.94 
 
 		 675 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.222575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2169  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.7 
 
 		 818 aa  45.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.79 
 
 		 689 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2570  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 		 521 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.46 
 
 		 558 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2637  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 		 521 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.68 
 
 		 802 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.7 
 
 		 797 aa  43.9  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5353  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 490 aa  43.9  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>