19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2604 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2604  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 716 aa  1392    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248661  hitchhiker  0.00161973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3101  putative serine protease protein  29.18 
 
 		 664 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.672072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46087  predicted protein  30.24 
 
 		 907 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0770  hypothetical protein  30.09 
 
 		 953 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4257  fibronectin type III domain-containing protein  31.1 
 
 		 634 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.735386  normal  0.703985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  25.73 
 
 		 1056 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4222  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1233 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.514353  normal  0.0934006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1890  cell surface protein  25.1 
 
 		 671 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2494  cell surface protein  25.15 
 
 		 462 aa  90.9  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.909338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03876  putative serine protease protein  39.16 
 
 		 663 aa  90.9  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5141  Proprotein convertase P  28.77 
 
 		 938 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.488081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.4 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  31.93 
 
 		 867 aa  73.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1121 aa  72.4  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.98 
 
 		 1052 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.39 
 
 		 2476 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  40.18 
 
 		 1879 aa  45.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  43.82 
 
 		 2042 aa  44.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.12 
 
 		 1234 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>