29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0893 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0893  cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
363 aa  724    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0892  cell wall binding repeat 2-containing protein  48.75 
 
 
379 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0884  hypothetical protein  34.34 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1719  hypothetical protein  33.21 
 
 
296 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.436251 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0192  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.21 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1720  aminoacyl-tRNA synthetase, class II  34.39 
 
 
288 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.980612  normal  0.790966 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.45 
 
 
1045 aa  59.3  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  38.3 
 
 
1312 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.39 
 
 
962 aa  56.6  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.61 
 
 
649 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 
1141 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  33.93 
 
 
640 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.53 
 
 
510 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  26.27 
 
 
637 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.96 
 
 
619 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.8 
 
 
475 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.4 
 
 
530 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  28.85 
 
 
570 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.35 
 
 
538 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.58 
 
 
860 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.17 
 
 
795 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  36.05 
 
 
688 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.33 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1318  hypothetical protein  29.36 
 
 
664 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0187  hypothetical protein  29.36 
 
 
672 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  38.18 
 
 
551 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0594  hypothetical protein  27.62 
 
 
663 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0419099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.45 
 
 
847 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1359  hypothetical protein  25.45 
 
 
668 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000437253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>