85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0015 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  47.46 
 
 
781 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
760 aa  1548    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  46.88 
 
 
1045 aa  608  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  44.61 
 
 
744 aa  552  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  45.05 
 
 
747 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  41.01 
 
 
771 aa  522  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  41.72 
 
 
770 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  45.64 
 
 
764 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  44.3 
 
 
763 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  43.97 
 
 
763 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  38.24 
 
 
768 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  39.84 
 
 
746 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  37.12 
 
 
806 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  38.45 
 
 
825 aa  406  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  38.64 
 
 
811 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.88 
 
 
795 aa  264  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  33.43 
 
 
795 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  32.53 
 
 
795 aa  257  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  32.26 
 
 
796 aa  256  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  30.82 
 
 
918 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.16 
 
 
795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.16 
 
 
795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  32.16 
 
 
795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.16 
 
 
795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  31.82 
 
 
796 aa  250  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.13 
 
 
927 aa  250  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.93 
 
 
796 aa  250  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  31.31 
 
 
751 aa  249  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  33.54 
 
 
799 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  33.75 
 
 
799 aa  243  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  31.88 
 
 
795 aa  243  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  33.59 
 
 
799 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  33.44 
 
 
799 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.97 
 
 
796 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  33.12 
 
 
799 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  33.39 
 
 
799 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  33.28 
 
 
799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  33.28 
 
 
799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  33.28 
 
 
799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  32.12 
 
 
812 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  33.44 
 
 
795 aa  230  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  29.65 
 
 
924 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  31.71 
 
 
794 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  31.19 
 
 
794 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  31.41 
 
 
795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  31.41 
 
 
795 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  29.46 
 
 
856 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  29.52 
 
 
936 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  29.12 
 
 
936 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  28.5 
 
 
945 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  29.09 
 
 
935 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  29.55 
 
 
951 aa  206  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  28.02 
 
 
965 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  28.24 
 
 
865 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  28.55 
 
 
951 aa  196  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  29.74 
 
 
869 aa  194  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  28.3 
 
 
938 aa  185  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  28.46 
 
 
938 aa  184  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  29.62 
 
 
867 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  29.49 
 
 
865 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  29.17 
 
 
871 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  28.17 
 
 
871 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  29.78 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  27.3 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3357  hypothetical protein  31.48 
 
 
666 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00235574  hitchhiker  0.000266176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  23.2 
 
 
1367 aa  65.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  32.5 
 
 
633 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  36.42 
 
 
1096 aa  64.7  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  36.42 
 
 
1028 aa  64.7  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  30.26 
 
 
513 aa  63.9  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40744  predicted protein  25 
 
 
583 aa  62.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  24.32 
 
 
811 aa  62.4  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  33.53 
 
 
735 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  29.01 
 
 
574 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  28.22 
 
 
666 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  26.34 
 
 
666 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.27 
 
 
566 aa  57.4  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  40.7 
 
 
1076 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  29.73 
 
 
998 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  32.14 
 
 
1024 aa  49.3  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  28.89 
 
 
1309 aa  47.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0132  hypothetical protein  27.76 
 
 
881 aa  47.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3339  hypothetical protein  29.75 
 
 
620 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  27.68 
 
 
778 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  22.83 
 
 
984 aa  45.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>