28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3710 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 747 aa  1496    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  28.89 
 
 		 633 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  26.25 
 
 		 666 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  34.1 
 
 		 1309 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  24.65 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  36.89 
 
 		 770 aa  71.2  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3357  hypothetical protein  22.89 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00235574  hitchhiker  0.000266176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  28.16 
 
 		 763 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  33.88 
 
 		 764 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  34.13 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  36.04 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3339  hypothetical protein  22.91 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  32 
 
 		 751 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  29.48 
 
 		 936 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  29.48 
 
 		 936 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  29.55 
 
 		 856 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  30.47 
 
 		 763 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  32.23 
 
 		 763 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  36.79 
 
 		 781 aa  52  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  30.16 
 
 		 825 aa  51.2  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  31.97 
 
 		 938 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.03 
 
 		 744 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  32.46 
 
 		 760 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  27.84 
 
 		 935 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  29.06 
 
 		 918 aa  46.6  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.01 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.09 
 
 		 1045 aa  45.8  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  29.29 
 
 		 806 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>