119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3341 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  100 
 
 
1087 aa  2165    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  62.19 
 
 
1056 aa  1248    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  25.31 
 
 
725 aa  140  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  25.95 
 
 
730 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  24.38 
 
 
1346 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  38.79 
 
 
717 aa  102  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  31.06 
 
 
492 aa  101  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  32.85 
 
 
515 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  36.75 
 
 
703 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  43.22 
 
 
764 aa  99.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  34.18 
 
 
483 aa  97.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  30.99 
 
 
582 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  26.48 
 
 
688 aa  96.3  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  41.72 
 
 
716 aa  94.7  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  30.71 
 
 
596 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  27.46 
 
 
493 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  28.61 
 
 
494 aa  93.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  44.07 
 
 
649 aa  92.8  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  35.38 
 
 
493 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  41.67 
 
 
569 aa  92.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  30.62 
 
 
464 aa  91.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  38.56 
 
 
646 aa  87.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  29.41 
 
 
487 aa  86.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  29.88 
 
 
636 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  29.88 
 
 
636 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  32.95 
 
 
721 aa  84.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  31.05 
 
 
476 aa  83.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  32.09 
 
 
721 aa  80.9  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  31.66 
 
 
556 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  31.61 
 
 
1459 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  24.93 
 
 
631 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  30.9 
 
 
1485 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  34.97 
 
 
767 aa  74.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  37.5 
 
 
578 aa  74.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  34.43 
 
 
1094 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.52 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  32.76 
 
 
523 aa  67.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  29.01 
 
 
499 aa  65.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 
515 aa  65.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  29.75 
 
 
528 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  35.25 
 
 
647 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  35.92 
 
 
687 aa  62.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  37.5 
 
 
706 aa  62.4  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  34.48 
 
 
664 aa  62  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.3 
 
 
508 aa  61.6  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  32.11 
 
 
676 aa  61.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  29.51 
 
 
698 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  24.74 
 
 
514 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  36.56 
 
 
382 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  34.86 
 
 
631 aa  60.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  32.73 
 
 
532 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  27.88 
 
 
513 aa  58.9  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  31.13 
 
 
677 aa  58.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  34.51 
 
 
840 aa  57.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  37.5 
 
 
490 aa  57.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.27 
 
 
513 aa  57.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  31.62 
 
 
522 aa  56.6  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  30.36 
 
 
533 aa  56.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  29.81 
 
 
539 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  33.64 
 
 
625 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.78 
 
 
487 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.72 
 
 
535 aa  55.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  24.74 
 
 
463 aa  53.9  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  34.21 
 
 
620 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  29.2 
 
 
515 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 
535 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 
535 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  30.11 
 
 
528 aa  53.5  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  25.22 
 
 
780 aa  53.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
586 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
591 aa  52.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
536 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
536 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.69 
 
 
536 aa  52.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.69 
 
 
536 aa  52.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
536 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  35.63 
 
 
542 aa  52.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  30.97 
 
 
531 aa  52  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
579 aa  51.6  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  33.33 
 
 
321 aa  52  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  30.69 
 
 
516 aa  52  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  30.97 
 
 
532 aa  52  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  35.16 
 
 
661 aa  51.6  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 
535 aa  51.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  32.35 
 
 
496 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  24.14 
 
 
460 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.46 
 
 
532 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  29.09 
 
 
536 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  30.25 
 
 
538 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 
499 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  31.43 
 
 
536 aa  50.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  40 
 
 
551 aa  49.7  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  30.14 
 
 
294 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  23.42 
 
 
592 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.32 
 
 
519 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  31.13 
 
 
527 aa  48.9  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  32.35 
 
 
643 aa  48.9  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  31.03 
 
 
569 aa  48.1  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  34.52 
 
 
502 aa  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  34.52 
 
 
502 aa  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>