201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1253 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  100 
 
 		 725 aa  1496    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  50.07 
 
 		 717 aa  683    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  65.22 
 
 		 688 aa  926    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  48.35 
 
 		 730 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  49.4 
 
 		 703 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  48.15 
 
 		 716 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  46.25 
 
 		 721 aa  588  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  45.59 
 
 		 721 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  46.83 
 
 		 649 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  46.08 
 
 		 646 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  34.54 
 
 		 764 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.07 
 
 		 569 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.84 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  27.17 
 
 		 636 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  27.17 
 
 		 636 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  25.28 
 
 		 487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  27.29 
 
 		 1056 aa  144  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  25.62 
 
 		 1087 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  25.57 
 
 		 767 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  23.3 
 
 		 464 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  50 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  50 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  24.43 
 
 		 631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  23.21 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  30.74 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  28.63 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  23.59 
 
 		 532 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  23.79 
 
 		 535 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  30.58 
 
 		 515 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  23.6 
 
 		 533 aa  95.5  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  23.21 
 
 		 535 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  23.21 
 
 		 535 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.54 
 
 		 586 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  28.04 
 
 		 582 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  22.37 
 
 		 536 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  22.37 
 
 		 536 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.54 
 
 		 536 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.54 
 
 		 536 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.54 
 
 		 536 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  28.57 
 
 		 476 aa  90.1  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  30.97 
 
 		 578 aa  89.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  24.93 
 
 		 664 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.81 
 
 		 591 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  26.85 
 
 		 539 aa  87.8  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.54 
 
 		 579 aa  87.8  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  22.2 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  23.92 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  34.44 
 
 		 1346 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  19.43 
 
 		 513 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  38.05 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  23.23 
 
 		 534 aa  80.5  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  23.23 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  19.26 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  38.1 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  25.78 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  34.53 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  24.22 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.45 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1485 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  31.15 
 
 		 1459 aa  65.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.7 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  21.56 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  30.6 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  24.05 
 
 		 780 aa  60.8  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  20.57 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  29.41 
 
 		 515 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  31.62 
 
 		 519 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  20.79 
 
 		 569 aa  55.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 527 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  31.58 
 
 		 514 aa  55.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  31.53 
 
 		 528 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  30.72 
 
 		 625 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  29.82 
 
 		 551 aa  54.3  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  27.47 
 
 		 460 aa  53.9  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  29.32 
 
 		 452 aa  52.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  31.25 
 
 		 519 aa  52.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  31.03 
 
 		 516 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  24.57 
 
 		 502 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  24.57 
 
 		 502 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  31.62 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  31.62 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  31.62 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  31.62 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  31.62 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  31.62 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  31.62 
 
 		 529 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  31.62 
 
 		 529 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.62 
 
 		 529 aa  52.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  34.17 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.51 
 
 		 506 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  30.63 
 
 		 542 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  33.33 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.24 
 
 		 437 aa  52  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  31.16 
 
 		 457 aa  51.6  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 476 aa  51.6  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  22.2 
 
 		 523 aa  51.6  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 467 aa  51.2  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.23 
 
 		 464 aa  51.6  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.55 
 
 		 486 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  25.71 
 
 		 294 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>