149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2231 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  48.07 
 
 
717 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  60.97 
 
 
730 aa  909    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  100 
 
 
721 aa  1502    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  96.53 
 
 
721 aa  1457    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  45.98 
 
 
688 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  47.66 
 
 
703 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  47.12 
 
 
716 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  45.59 
 
 
725 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  44.12 
 
 
649 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  43.68 
 
 
646 aa  502  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  31.74 
 
 
764 aa  321  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  32.45 
 
 
569 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  31.69 
 
 
556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  26.28 
 
 
636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  26.28 
 
 
636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  25.04 
 
 
487 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  33.86 
 
 
767 aa  110  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  42.25 
 
 
493 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  42.25 
 
 
493 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  21.61 
 
 
631 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  25.8 
 
 
476 aa  91.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  23.56 
 
 
515 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  25.23 
 
 
494 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  36.43 
 
 
464 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  22.68 
 
 
534 aa  86.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  22.68 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 
492 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 
515 aa  82  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  26.3 
 
 
532 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  32.09 
 
 
1087 aa  80.9  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  22.37 
 
 
664 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  36.89 
 
 
1056 aa  79  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  35.82 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  21.79 
 
 
780 aa  75.1  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  26.25 
 
 
596 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  24.16 
 
 
539 aa  70.5  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  23.66 
 
 
1346 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  29.05 
 
 
578 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  31.78 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.37 
 
 
490 aa  64.3  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  30.38 
 
 
1459 aa  62.4  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  22.59 
 
 
631 aa  61.6  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  21.22 
 
 
499 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  32.26 
 
 
514 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  29.5 
 
 
492 aa  60.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.28 
 
 
579 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
586 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  29.41 
 
 
1485 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
536 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
536 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
536 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  29.46 
 
 
536 aa  58.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 
591 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  30.23 
 
 
536 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  32.26 
 
 
522 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  29.84 
 
 
513 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  30.23 
 
 
536 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  26.47 
 
 
527 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  31.5 
 
 
533 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  29.03 
 
 
513 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  21.64 
 
 
625 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  30.71 
 
 
531 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  21.1 
 
 
382 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.5 
 
 
535 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.91 
 
 
535 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.91 
 
 
535 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  30.71 
 
 
532 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  30.71 
 
 
535 aa  54.7  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  20.62 
 
 
533 aa  54.7  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.12 
 
 
528 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.91 
 
 
515 aa  54.3  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  29.55 
 
 
569 aa  53.9  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  25.58 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  29.14 
 
 
505 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 
542 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  30 
 
 
516 aa  51.6  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  29.85 
 
 
528 aa  51.2  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 
502 aa  51.2  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 
502 aa  51.2  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  24.54 
 
 
358 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  22.86 
 
 
519 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  36.23 
 
 
645 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  30.08 
 
 
706 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  31.19 
 
 
643 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  29.66 
 
 
523 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  25.68 
 
 
551 aa  50.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  29.86 
 
 
460 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  34.23 
 
 
551 aa  49.3  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  21.79 
 
 
470 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  32.77 
 
 
486 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  31.4 
 
 
676 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  22.78 
 
 
437 aa  49.3  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  23.48 
 
 
487 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  25.31 
 
 
294 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  26.77 
 
 
620 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  27.91 
 
 
499 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  29.41 
 
 
532 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  24.41 
 
 
364 aa  48.5  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.14 
 
 
496 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  28.91 
 
 
506 aa  47.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>