187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1017 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  85.1 
 
 		 703 aa  1211    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  100 
 
 		 716 aa  1464    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  51.42 
 
 		 688 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  52.05 
 
 		 649 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  50.95 
 
 		 646 aa  611  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  47.64 
 
 		 717 aa  598  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  48.15 
 
 		 725 aa  598  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  44.15 
 
 		 721 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  44.9 
 
 		 721 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  45.97 
 
 		 730 aa  558  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  36.35 
 
 		 764 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.73 
 
 		 569 aa  284  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.1 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  30 
 
 		 636 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  30 
 
 		 636 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  28.05 
 
 		 487 aa  163  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  25.46 
 
 		 1346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  42.2 
 
 		 493 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  42.2 
 
 		 493 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  24.13 
 
 		 631 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  25.88 
 
 		 582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  36.58 
 
 		 767 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  36.65 
 
 		 464 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  24.52 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  24.06 
 
 		 476 aa  98.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  29.54 
 
 		 494 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  26.93 
 
 		 664 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  41.72 
 
 		 1087 aa  95.1  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  42.86 
 
 		 1056 aa  89.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  23.66 
 
 		 536 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  23.66 
 
 		 536 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  28.4 
 
 		 492 aa  88.2  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.49 
 
 		 586 aa  87.4  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.49 
 
 		 536 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.49 
 
 		 536 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.49 
 
 		 536 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  29.34 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  30.94 
 
 		 578 aa  84.7  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  24.83 
 
 		 780 aa  82.4  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  37.07 
 
 		 515 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  31.54 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  34.59 
 
 		 536 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  23.46 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 515 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  31.58 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  31.69 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  23.28 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  33.07 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  33.07 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  30.87 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  33.82 
 
 		 487 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1485 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  33.1 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  33.1 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  29.5 
 
 		 1459 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.39 
 
 		 508 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  34.35 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  29.31 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  29.31 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.33 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  21.8 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  28.36 
 
 		 532 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  21.49 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.01 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  24.87 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  33.08 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  31.71 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  29.87 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  31.82 
 
 		 321 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.78 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 591 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  28.88 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.66 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  32.58 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  32.58 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  22.16 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  30.12 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  28.88 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  28.63 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.78 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.96 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  28.82 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  28.82 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  21.49 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  29.19 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  33.56 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  28.19 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  28.45 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 		 431 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  26.28 
 
 		 449 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  24.8 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  24.8 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.77 
 
 		 519 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  26.71 
 
 		 294 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  28.07 
 
 		 467 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 		 431 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  29 
 
 		 431 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  29 
 
 		 431 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  20.98 
 
 		 625 aa  55.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  25.99 
 
 		 317 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>