More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0315 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  100 
 
 		 569 aa  1191    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  50.18 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  37.75 
 
 		 649 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  36.47 
 
 		 646 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  34.63 
 
 		 688 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  35.73 
 
 		 716 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  32.13 
 
 		 717 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  32.45 
 
 		 721 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  35.01 
 
 		 703 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  32.45 
 
 		 721 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  33.07 
 
 		 725 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  31.32 
 
 		 730 aa  251  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  34.13 
 
 		 487 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  30.96 
 
 		 764 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  30.68 
 
 		 464 aa  227  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  29.26 
 
 		 493 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  30.19 
 
 		 636 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  29.07 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  30.19 
 
 		 636 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  32.03 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  30.98 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  30.91 
 
 		 476 aa  193  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  29.08 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  27.87 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  27.72 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  26.96 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  27.03 
 
 		 532 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  27.75 
 
 		 582 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  26.54 
 
 		 631 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  31.86 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  27.32 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  30.29 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  33.92 
 
 		 767 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  26.73 
 
 		 596 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  27.38 
 
 		 490 aa  123  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.8 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.88 
 
 		 579 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  27.03 
 
 		 514 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  24.61 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  25.87 
 
 		 533 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  25.56 
 
 		 486 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  26.84 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  26.84 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  26.92 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.16 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  25.47 
 
 		 531 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.85 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  26.31 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  27.23 
 
 		 513 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.63 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.63 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  26.11 
 
 		 534 aa  107  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.67 
 
 		 522 aa  107  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  25.26 
 
 		 532 aa  107  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  25.79 
 
 		 506 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.09 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  25.51 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  23.35 
 
 		 502 aa  98.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  23.35 
 
 		 502 aa  98.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  23.51 
 
 		 538 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  26.08 
 
 		 547 aa  97.8  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  25.3 
 
 		 539 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  23.74 
 
 		 516 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  23.74 
 
 		 516 aa  94  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  23.74 
 
 		 516 aa  94  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  23.74 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  23.74 
 
 		 516 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  41.67 
 
 		 1087 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  24.04 
 
 		 529 aa  91.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  24.04 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  23.33 
 
 		 496 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.46 
 
 		 437 aa  91.3  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  23.03 
 
 		 546 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  23.84 
 
 		 529 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  31.87 
 
 		 1056 aa  90.1  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  23.84 
 
 		 529 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  23.86 
 
 		 512 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  36.57 
 
 		 1346 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  23.94 
 
 		 539 aa  87.8  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  23.78 
 
 		 527 aa  87.8  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  22.26 
 
 		 546 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  23.47 
 
 		 524 aa  87  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  22.52 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  22.05 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  22.05 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  23.39 
 
 		 536 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  22.33 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  22.39 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  22.39 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  23.8 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  23.8 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  23.51 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  23.51 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  24.1 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  24.53 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  21.18 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>