157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1337 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  100 
 
 		 764 aa  1579    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  35.6 
 
 		 649 aa  352  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  34.28 
 
 		 688 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  36.12 
 
 		 703 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  36.35 
 
 		 716 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  33.43 
 
 		 730 aa  346  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  33.21 
 
 		 725 aa  339  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  34.36 
 
 		 717 aa  330  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  36.42 
 
 		 646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  32.03 
 
 		 721 aa  326  9e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  31.74 
 
 		 721 aa  321  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  30.8 
 
 		 569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  28.29 
 
 		 556 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  29.88 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  31.25 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  31.25 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  36.36 
 
 		 493 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  38.78 
 
 		 494 aa  101  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  36.36 
 
 		 493 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  43.22 
 
 		 1087 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  34.33 
 
 		 767 aa  95.9  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  35.98 
 
 		 515 aa  95.1  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  40.17 
 
 		 492 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  36.44 
 
 		 464 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  39.83 
 
 		 1056 aa  88.6  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  35.8 
 
 		 382 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  32.88 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  38.28 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  35.54 
 
 		 515 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  37.29 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  32.82 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 		 582 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  32.06 
 
 		 321 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  32.06 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  33.85 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  33.59 
 
 		 514 aa  77  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  29.94 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  29.76 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  32.67 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  30.14 
 
 		 499 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  31.37 
 
 		 596 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  31.54 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  34.23 
 
 		 1346 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  30.77 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.23 
 
 		 536 aa  70.1  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  30 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  30 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  29.8 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  25 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  30 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  32.89 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.46 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  23.66 
 
 		 760 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.73 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.47 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.95 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  28.64 
 
 		 506 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  29.23 
 
 		 532 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 591 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  28.21 
 
 		 1459 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 579 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  28.93 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  28.24 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  28.24 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  30.16 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  30.16 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  30.53 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1485 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  30.91 
 
 		 664 aa  62  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  29.45 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  27.14 
 
 		 508 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  27.78 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  25.93 
 
 		 499 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.58 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  30.28 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.36 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  26.09 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  29.85 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.47 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  22.54 
 
 		 625 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  26.79 
 
 		 523 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  29.36 
 
 		 706 aa  55.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  28.24 
 
 		 569 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  27.54 
 
 		 542 aa  55.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  28.97 
 
 		 294 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  28.38 
 
 		 516 aa  54.7  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  25.16 
 
 		 529 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  25.16 
 
 		 529 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  25.85 
 
 		 551 aa  54.3  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  25.16 
 
 		 529 aa  54.3  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  32.08 
 
 		 647 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  25.16 
 
 		 516 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  27.78 
 
 		 556 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.19 
 
 		 1094 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.78 
 
 		 486 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>