More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6753 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 382 aa  771    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  34.84 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  32.87 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  33.58 
 
 		 492 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.32 
 
 		 569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.93 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  31.15 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  30.23 
 
 		 532 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  29.1 
 
 		 515 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  29.34 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  28.96 
 
 		 493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.66 
 
 		 556 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  28.44 
 
 		 515 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  30.67 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.08 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  26.83 
 
 		 578 aa  99.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  26.69 
 
 		 499 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  31.08 
 
 		 533 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.9 
 
 		 579 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  32.89 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  27.03 
 
 		 514 aa  92.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 586 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 591 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  31.47 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  31.47 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  31.47 
 
 		 535 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  31.47 
 
 		 535 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  33.91 
 
 		 531 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  33.91 
 
 		 532 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  28.29 
 
 		 513 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.9 
 
 		 535 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  33.05 
 
 		 535 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  27.09 
 
 		 513 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  26.18 
 
 		 631 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  35.8 
 
 		 764 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  31.93 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.15 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.15 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  26.35 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  30.6 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.88 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  27.2 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  28.3 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  26.17 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  27.96 
 
 		 636 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  27.96 
 
 		 636 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89638  Multicopper oxidase  26.94 
 
 		 626 aa  77.4  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.951464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.28 
 
 		 522 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  27.61 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.33 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  26.77 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.93 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  33.09 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  27.79 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  28.21 
 
 		 607 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  34.53 
 
 		 725 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  30.5 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  26.45 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  31.87 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  27.48 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  35.66 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  31.58 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  27.65 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  25.67 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  26.74 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  24.92 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  26.72 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  30.65 
 
 		 621 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  25.86 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79365  multicopper oxidase   29.54 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  26.05 
 
 		 594 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.35 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  26.09 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  34.88 
 
 		 646 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  34.16 
 
 		 551 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  25.5 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  24.17 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  25.39 
 
 		 605 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  24.7 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  27.73 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.05 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  29.13 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  27.53 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  25.46 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.52 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  26.16 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  26.74 
 
 		 592 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  28.38 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  26.35 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  33.75 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  28.34 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  28.52 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  26.6 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.16 
 
 		 496 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  26.28 
 
 		 456 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>