147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1407 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  50.49 
 
 
717 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  100 
 
 
730 aa  1523    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  60.97 
 
 
721 aa  909    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  61.38 
 
 
721 aa  921    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  46.6 
 
 
688 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  48.35 
 
 
725 aa  604  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  45.97 
 
 
716 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  43.93 
 
 
703 aa  552  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  43.12 
 
 
649 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  42.35 
 
 
646 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  33.66 
 
 
764 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  31.32 
 
 
569 aa  251  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.24 
 
 
556 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  27.12 
 
 
636 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  27.12 
 
 
636 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  28.04 
 
 
767 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  24.2 
 
 
487 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  25.89 
 
 
1087 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  23.59 
 
 
1346 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  22.12 
 
 
578 aa  96.3  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  31.63 
 
 
494 aa  94.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  35.46 
 
 
493 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  35.46 
 
 
493 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  21.89 
 
 
515 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  31.22 
 
 
492 aa  88.6  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  29.61 
 
 
515 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  22.39 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  23.3 
 
 
631 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  22.39 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  22.1 
 
 
664 aa  81.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  32.62 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  31.82 
 
 
1056 aa  77.8  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  25.64 
 
 
476 aa  73.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  32.88 
 
 
582 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  30.18 
 
 
596 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  42.47 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  23.99 
 
 
533 aa  68.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  32.06 
 
 
499 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  20.22 
 
 
516 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  20.59 
 
 
516 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  30.08 
 
 
512 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  20.04 
 
 
516 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  20.04 
 
 
516 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  20.04 
 
 
516 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  20.04 
 
 
529 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  20.04 
 
 
529 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  31.54 
 
 
536 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  36.96 
 
 
492 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  20.04 
 
 
516 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  20.04 
 
 
529 aa  63.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  31.3 
 
 
515 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  27.7 
 
 
294 aa  61.6  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  29.25 
 
 
1459 aa  61.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  22.05 
 
 
539 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  25.49 
 
 
532 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  30.53 
 
 
513 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  30.53 
 
 
321 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.41 
 
 
487 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  29.66 
 
 
1485 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  30.53 
 
 
513 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  19.54 
 
 
539 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  30.53 
 
 
528 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  21.01 
 
 
524 aa  58.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 
496 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
586 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
536 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
536 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
536 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  32.58 
 
 
514 aa  57.4  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 
591 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  38.2 
 
 
490 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.23 
 
 
536 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.23 
 
 
536 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  31.03 
 
 
780 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.41 
 
 
519 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  21.57 
 
 
677 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  26.92 
 
 
535 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  26.92 
 
 
535 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  33.33 
 
 
528 aa  54.7  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  24.21 
 
 
676 aa  54.7  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.58 
 
 
486 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  23.08 
 
 
645 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  22.87 
 
 
760 aa  54.3  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  19.96 
 
 
536 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  19.96 
 
 
536 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  19.96 
 
 
536 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  30 
 
 
502 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  30 
 
 
502 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  19.96 
 
 
536 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  28.7 
 
 
508 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  20.81 
 
 
382 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  29.77 
 
 
505 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  22.37 
 
 
631 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.92 
 
 
533 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  30.16 
 
 
516 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.69 
 
 
535 aa  53.5  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.15 
 
 
535 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  27.69 
 
 
532 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  35.96 
 
 
570 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 
579 aa  52.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>