188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04807 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  100 
 
 		 717 aa  1488    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  48.07 
 
 		 721 aa  672    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  50.49 
 
 		 730 aa  680    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  48.36 
 
 		 721 aa  673    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  50.07 
 
 		 725 aa  683    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  50.64 
 
 		 688 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  47.55 
 
 		 703 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  47.64 
 
 		 716 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  47.38 
 
 		 649 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  47.61 
 
 		 646 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  34.36 
 
 		 764 aa  330  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  32.13 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.76 
 
 		 556 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  28.28 
 
 		 636 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  28.28 
 
 		 636 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  25.95 
 
 		 487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  24.51 
 
 		 464 aa  141  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 		 493 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  24.83 
 
 		 631 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  31.82 
 
 		 767 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  24.75 
 
 		 476 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  31.67 
 
 		 494 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  38.79 
 
 		 1087 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 515 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  31.67 
 
 		 492 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  24.69 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  25.79 
 
 		 532 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  24.91 
 
 		 536 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  25.09 
 
 		 536 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.21 
 
 		 586 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.21 
 
 		 536 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.21 
 
 		 536 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.21 
 
 		 536 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.83 
 
 		 591 aa  90.9  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  28.04 
 
 		 483 aa  90.9  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  22.96 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  23.92 
 
 		 664 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  22.96 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  22.64 
 
 		 780 aa  88.2  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  24.61 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  24.61 
 
 		 535 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  24 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  24.4 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  36.55 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  36.17 
 
 		 1346 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  40.5 
 
 		 1056 aa  81.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  25.15 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  30.69 
 
 		 578 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  21.65 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  34.25 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  23.53 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  24.45 
 
 		 631 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  24.17 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  21.18 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  28.3 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  29.45 
 
 		 1459 aa  63.9  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  36.73 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  24.1 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  35.96 
 
 		 513 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  35.09 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.22 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  35.92 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  36.36 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  29.49 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  24.5 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1485 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.88 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  34.51 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  27.04 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  27.04 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  24.44 
 
 		 630 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 542 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 		 452 aa  55.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.33 
 
 		 486 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  24 
 
 		 554 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  24 
 
 		 554 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  24.22 
 
 		 294 aa  54.3  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  21.01 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  21.93 
 
 		 547 aa  53.9  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  24.25 
 
 		 645 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.5 
 
 		 437 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.75 
 
 		 496 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  24.33 
 
 		 609 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  22.73 
 
 		 946 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  20.04 
 
 		 463 aa  52.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  23.65 
 
 		 528 aa  52.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  27.48 
 
 		 506 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  27.76 
 
 		 432 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  27.76 
 
 		 432 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  27.53 
 
 		 431 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  29.09 
 
 		 434 aa  51.2  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  29.09 
 
 		 434 aa  51.2  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 569 aa  51.2  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.19 
 
 		 551 aa  50.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  27.53 
 
 		 431 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  26.25 
 
 		 455 aa  50.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  29.77 
 
 		 321 aa  50.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  32.74 
 
 		 643 aa  50.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>