192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2661 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  100 
 
 		 703 aa  1436    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  85.1 
 
 		 716 aa  1239    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  48.16 
 
 		 688 aa  633  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  51.55 
 
 		 649 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  48.22 
 
 		 725 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  47.69 
 
 		 717 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  50.44 
 
 		 646 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  47.66 
 
 		 721 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  47.66 
 
 		 721 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  43.8 
 
 		 730 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  36.53 
 
 		 764 aa  349  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.01 
 
 		 569 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.52 
 
 		 556 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  30.37 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  30.37 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  27.27 
 
 		 487 aa  160  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  42.17 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  42.17 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  24.39 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  34.23 
 
 		 767 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  24.45 
 
 		 1346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  23.46 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  24.6 
 
 		 596 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  24.87 
 
 		 582 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  24.48 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  36.75 
 
 		 1087 aa  101  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  36.65 
 
 		 464 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  28.3 
 
 		 494 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  26.83 
 
 		 664 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  27.57 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  24.32 
 
 		 532 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  39.1 
 
 		 1056 aa  89.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  28.52 
 
 		 515 aa  87.8  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  21.93 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  24.49 
 
 		 780 aa  84  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  23.18 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  23.18 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.01 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  32.26 
 
 		 483 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.01 
 
 		 536 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.01 
 
 		 536 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.01 
 
 		 536 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  21.76 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.24 
 
 		 536 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  31.87 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  23.3 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  32.84 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.21 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  29.86 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  31.01 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  31.01 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.17 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  31.94 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  27.32 
 
 		 321 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.91 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  31.94 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  24.23 
 
 		 528 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  29.94 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  25.93 
 
 		 533 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  21.76 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  21.2 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  21.2 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  24.88 
 
 		 1459 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1485 aa  61.6  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  28.37 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  30.94 
 
 		 487 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  29.77 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.42 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  21.76 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  21.94 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  21.18 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.01 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  31.87 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  26.78 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  30.47 
 
 		 514 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  33.33 
 
 		 643 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  26.04 
 
 		 490 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  20.54 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  23 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.53 
 
 		 516 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  23.4 
 
 		 631 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  28.57 
 
 		 455 aa  55.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  24.48 
 
 		 625 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  27.72 
 
 		 630 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.98 
 
 		 535 aa  54.3  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  26.88 
 
 		 317 aa  54.3  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.11 
 
 		 531 aa  53.9  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  27.47 
 
 		 462 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  32.54 
 
 		 535 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  32.54 
 
 		 535 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  30.49 
 
 		 532 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  20.3 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  20.3 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  32.85 
 
 		 528 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 		 459 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.75 
 
 		 535 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  22.49 
 
 		 522 aa  52.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  26.92 
 
 		 519 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>