83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39129 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  29.7 
 
 		 492 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  27.9 
 
 		 487 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  25.49 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.23 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  29.19 
 
 		 582 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  28.22 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  28.22 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  26.7 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  30.13 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  27.93 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.04 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  24.22 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  27.7 
 
 		 730 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  23.5 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  24.39 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  23.28 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  24.39 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  26.78 
 
 		 703 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.13 
 
 		 514 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  24.54 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  26.71 
 
 		 716 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  28.48 
 
 		 764 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  21.19 
 
 		 483 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  25.25 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  26.22 
 
 		 649 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 		 515 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  23.47 
 
 		 536 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  23.47 
 
 		 536 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  25.93 
 
 		 721 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  25.51 
 
 		 515 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  22.37 
 
 		 476 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.47 
 
 		 591 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  24.08 
 
 		 487 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  27.23 
 
 		 528 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.68 
 
 		 536 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.68 
 
 		 536 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.68 
 
 		 536 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  34.78 
 
 		 1346 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.68 
 
 		 586 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  25.61 
 
 		 646 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  26.19 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  25.36 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  25.71 
 
 		 725 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.16 
 
 		 579 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  35.14 
 
 		 1056 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  23.35 
 
 		 463 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  22.18 
 
 		 631 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  24.21 
 
 		 533 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  28.97 
 
 		 1087 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  23.68 
 
 		 535 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  26.21 
 
 		 358 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  25.31 
 
 		 721 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  23.68 
 
 		 535 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  23.83 
 
 		 532 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  22.84 
 
 		 463 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  24.37 
 
 		 532 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  23.68 
 
 		 531 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  23.59 
 
 		 466 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  28.85 
 
 		 578 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  22.66 
 
 		 556 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  22.11 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  23.94 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  23.16 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  23.16 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  24.61 
 
 		 516 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  22.52 
 
 		 594 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  22.81 
 
 		 636 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  22.71 
 
 		 516 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  22.81 
 
 		 636 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  21.46 
 
 		 524 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  21.15 
 
 		 676 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  21.33 
 
 		 532 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  22.71 
 
 		 529 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  22.71 
 
 		 529 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  22.71 
 
 		 529 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  21.98 
 
 		 478 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  24.34 
 
 		 476 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  24.17 
 
 		 647 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  43.75 
 
 		 364 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  24.37 
 
 		 505 aa  42.4  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  22.33 
 
 		 434 aa  42.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  22.33 
 
 		 434 aa  42.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>