194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6131 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 646 aa  1335    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  93.69 
 
 		 649 aa  1236    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  50.88 
 
 		 716 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  52.09 
 
 		 703 aa  611  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  45.32 
 
 		 688 aa  581  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  47.61 
 
 		 717 aa  555  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  46.08 
 
 		 725 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  42.77 
 
 		 721 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  43.68 
 
 		 721 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  42.35 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  36.42 
 
 		 764 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.47 
 
 		 569 aa  290  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.99 
 
 		 556 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  30.37 
 
 		 636 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  30.37 
 
 		 636 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  27.84 
 
 		 487 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.7 
 
 		 464 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  36.84 
 
 		 767 aa  123  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  24.64 
 
 		 631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  25.05 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.31 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  25.54 
 
 		 1056 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  25.95 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  25.37 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.56 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.56 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  25.37 
 
 		 535 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.09 
 
 		 579 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  34.6 
 
 		 492 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  34.9 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  34.9 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 515 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  24.28 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  33.78 
 
 		 494 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  23.99 
 
 		 536 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  23.99 
 
 		 536 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.09 
 
 		 591 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.84 
 
 		 586 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.84 
 
 		 536 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.84 
 
 		 536 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.84 
 
 		 536 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  25.79 
 
 		 532 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  32.56 
 
 		 515 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  26.36 
 
 		 531 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  28.62 
 
 		 483 aa  94.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  21.97 
 
 		 513 aa  94  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  22.71 
 
 		 596 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  27.85 
 
 		 476 aa  92.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  23.56 
 
 		 534 aa  90.9  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  23.56 
 
 		 534 aa  90.9  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  21.59 
 
 		 513 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  38.56 
 
 		 1087 aa  87.8  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  21.49 
 
 		 533 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  26.65 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  23.08 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  23.58 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  31.69 
 
 		 578 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  24.72 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  24.68 
 
 		 528 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  33.57 
 
 		 1346 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1485 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  25.42 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  24.16 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  26.35 
 
 		 1459 aa  78.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  22.41 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  24.46 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  22.32 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  22.95 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  22.55 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  22.81 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  22.81 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  22.81 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  22.34 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  23.12 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  22.27 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  23.05 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  34.88 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  22.82 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  22.26 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  30.43 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  23.9 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  27.18 
 
 		 551 aa  67  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  22.34 
 
 		 533 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.53 
 
 		 536 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  22.67 
 
 		 760 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  23.67 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  32.28 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  33.09 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  30.3 
 
 		 502 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  30.3 
 
 		 502 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  22.2 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  28.65 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  21.72 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  21.36 
 
 		 504 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  21.23 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>