103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1277 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  62.1 
 
 		 1087 aa  1232    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 1056 aa  2142    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  27.29 
 
 		 725 aa  144  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  26.4 
 
 		 688 aa  128  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  29.72 
 
 		 515 aa  97.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  23.68 
 
 		 1346 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  29.18 
 
 		 464 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  32.84 
 
 		 483 aa  92.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  31.37 
 
 		 492 aa  91.3  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  31.87 
 
 		 569 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  42.86 
 
 		 716 aa  89.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  39.1 
 
 		 703 aa  89  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  29.89 
 
 		 493 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  39.83 
 
 		 764 aa  88.2  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  30.06 
 
 		 493 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  31.4 
 
 		 582 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  38.52 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  35.53 
 
 		 646 aa  82.8  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  40.91 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  31.11 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  40.5 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  28.35 
 
 		 596 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  31.32 
 
 		 494 aa  81.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1485 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  36.89 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  27.88 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  31.82 
 
 		 730 aa  77.8  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  29.51 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  39.42 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  29.82 
 
 		 487 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  42.31 
 
 		 636 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  42.31 
 
 		 636 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  29.11 
 
 		 499 aa  72  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  31.37 
 
 		 1459 aa  70.1  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  31.44 
 
 		 840 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  23.58 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  33.04 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  31.9 
 
 		 523 aa  67.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  25.5 
 
 		 631 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  23.72 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  25.9 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  38 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  27.61 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 		 1094 aa  65.1  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  35.19 
 
 		 676 aa  63.9  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  33.87 
 
 		 528 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  35.19 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  30.87 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  33.33 
 
 		 698 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  23.08 
 
 		 625 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  29.02 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  35.29 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  32.43 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  31.78 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  31.18 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  31.45 
 
 		 542 aa  57.4  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 586 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 591 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.04 
 
 		 579 aa  56.2  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 536 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  28.48 
 
 		 513 aa  56.2  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 536 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  30.4 
 
 		 536 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  30.4 
 
 		 536 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 536 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  29.91 
 
 		 620 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  28.93 
 
 		 536 aa  56.2  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  28.48 
 
 		 513 aa  55.5  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  27.4 
 
 		 533 aa  55.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.3 
 
 		 514 aa  55.5  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  32.14 
 
 		 535 aa  54.7  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  32.14 
 
 		 535 aa  54.7  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  32.14 
 
 		 535 aa  54.7  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  23.97 
 
 		 592 aa  54.7  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  32.14 
 
 		 535 aa  54.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  32.46 
 
 		 531 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  33.96 
 
 		 527 aa  54.3  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  32.46 
 
 		 532 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  35.79 
 
 		 502 aa  53.5  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  35.79 
 
 		 502 aa  53.5  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  34 
 
 		 496 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  32.54 
 
 		 661 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  30.77 
 
 		 687 aa  52.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.68 
 
 		 515 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.14 
 
 		 487 aa  51.2  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  29.69 
 
 		 547 aa  50.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  37.5 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  28.7 
 
 		 536 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  30.71 
 
 		 516 aa  50.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  29.27 
 
 		 551 aa  49.7  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  26.45 
 
 		 538 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  25.23 
 
 		 565 aa  48.5  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.54 
 
 		 512 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32.97 
 
 		 570 aa  47.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  30.15 
 
 		 528 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  29.91 
 
 		 643 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21170  predicted multicopper oxidase  25.14 
 
 		 318 aa  46.2  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.365675 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  28.32 
 
 		 463 aa  45.8  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  23.11 
 
 		 1973 aa  45.8  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  39.71 
 
 		 569 aa  45.8  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>