81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2624 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2624  putative multicopper oxidase  100 
 
 		 664 aa  1377    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1089  multicopper oxidase type 2  30.37 
 
 		 780 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  26.83 
 
 		 703 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  26.93 
 
 		 716 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  23.92 
 
 		 717 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  23.55 
 
 		 688 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  24.93 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  24.32 
 
 		 582 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.47 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  22.1 
 
 		 730 aa  81.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  23.29 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  23.29 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  22.37 
 
 		 721 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  22.29 
 
 		 721 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  26.94 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  22.52 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  22.52 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  35.37 
 
 		 578 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  22.13 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  21.96 
 
 		 631 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  30.99 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  29.7 
 
 		 492 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  26.01 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  25.9 
 
 		 1056 aa  65.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  27.49 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  27.49 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  24.77 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  30.05 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  30.91 
 
 		 764 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  34.48 
 
 		 1087 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  29.48 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  31.75 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  34.78 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  33.09 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.67 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  31.67 
 
 		 535 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  31.67 
 
 		 535 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  32.54 
 
 		 596 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  25.41 
 
 		 539 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  28 
 
 		 687 aa  54.7  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  29.34 
 
 		 487 aa  54.7  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  24.27 
 
 		 476 aa  54.3  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  27.75 
 
 		 1094 aa  54.3  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  34.17 
 
 		 643 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  29.82 
 
 		 840 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  21.96 
 
 		 779 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  26 
 
 		 676 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  24.71 
 
 		 532 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  24.71 
 
 		 531 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  28.46 
 
 		 1346 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  28.33 
 
 		 535 aa  51.6  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  30.14 
 
 		 1459 aa  51.2  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  30.56 
 
 		 510 aa  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  27.51 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  28.1 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  27.52 
 
 		 677 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  24.39 
 
 		 625 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  29.82 
 
 		 647 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  23.06 
 
 		 492 aa  47.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  22.87 
 
 		 798 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  23.56 
 
 		 532 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1485 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  58.82 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  30.56 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  22.18 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  25.81 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  33.8 
 
 		 519 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  30.23 
 
 		 551 aa  45.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  23.58 
 
 		 647 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  20.63 
 
 		 779 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  22.36 
 
 		 661 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  27.87 
 
 		 506 aa  44.3  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  21.36 
 
 		 734 aa  43.9  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  23.18 
 
 		 798 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  26.54 
 
 		 457 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>