135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2591 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  62 
 
 		 1131 aa  1173    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2001  multicopper oxidase, type 2  61.69 
 
 		 936 aa  1129    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  62.22 
 
 		 1131 aa  1176    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  62.44 
 
 		 1131 aa  1181    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0649  multicopper oxidase type 2  64.09 
 
 		 945 aa  1228    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 895 aa  1849    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  59 
 
 		 877 aa  979    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  28.09 
 
 		 603 aa  187  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  30.39 
 
 		 760 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  24.56 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.41 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  25.6 
 
 		 647 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  23.76 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  25.53 
 
 		 677 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  24.72 
 
 		 515 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  25.12 
 
 		 508 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  24.55 
 
 		 625 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  25.7 
 
 		 676 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  27.05 
 
 		 631 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  23.62 
 
 		 625 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.74 
 
 		 528 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  25.43 
 
 		 487 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  22.59 
 
 		 512 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  24.12 
 
 		 661 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  25.42 
 
 		 799 aa  88.6  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  26.06 
 
 		 872 aa  85.1  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  23.26 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  24.66 
 
 		 706 aa  84  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  29.52 
 
 		 798 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  25.36 
 
 		 798 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  27.11 
 
 		 698 aa  81.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  25.3 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  25.21 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  25.31 
 
 		 533 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  26.27 
 
 		 645 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  26.65 
 
 		 779 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  28.17 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  21.57 
 
 		 1094 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  25.52 
 
 		 533 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  25.1 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  30.59 
 
 		 779 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  27.83 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  26.61 
 
 		 628 aa  67  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  24.07 
 
 		 519 aa  67.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  27.23 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  23.29 
 
 		 840 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  24.54 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  26.15 
 
 		 643 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  39.58 
 
 		 499 aa  62  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  29.33 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  29.33 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  39.08 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  37.11 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  21.54 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  31.45 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.64 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  24.24 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  22.57 
 
 		 734 aa  56.6  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  35.87 
 
 		 464 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  23.92 
 
 		 533 aa  57  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  27.52 
 
 		 470 aa  55.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  28.86 
 
 		 470 aa  55.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  24.06 
 
 		 496 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  34.83 
 
 		 492 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  30.23 
 
 		 470 aa  54.3  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  33.77 
 
 		 527 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.16 
 
 		 490 aa  53.5  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32.26 
 
 		 570 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  23.53 
 
 		 687 aa  52.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  21.8 
 
 		 510 aa  52.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  30.23 
 
 		 471 aa  52  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  33.64 
 
 		 483 aa  51.6  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  35.29 
 
 		 488 aa  51.2  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  25.15 
 
 		 1248 aa  51.2  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  27.27 
 
 		 470 aa  51.2  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  29.69 
 
 		 578 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  23.81 
 
 		 516 aa  50.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  21.68 
 
 		 538 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  32.95 
 
 		 493 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  34.34 
 
 		 636 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  27.91 
 
 		 471 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  34.34 
 
 		 636 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  32.95 
 
 		 493 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  26.74 
 
 		 532 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  31 
 
 		 515 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  31.25 
 
 		 716 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  25.12 
 
 		 551 aa  49.3  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  28.87 
 
 		 474 aa  48.9  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  28.17 
 
 		 474 aa  48.9  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>