89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0504 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 		 1676 aa  3474    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  64.28 
 
 		 1717 aa  2141    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  63.19 
 
 		 1658 aa  2111    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  26.57 
 
 		 1493 aa  355  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  25.9 
 
 		 1521 aa  348  7e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  28.87 
 
 		 1581 aa  346  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  26.06 
 
 		 1521 aa  340  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  29.95 
 
 		 1714 aa  258  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.85 
 
 		 1115 aa  249  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  31.39 
 
 		 1470 aa  242  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.94 
 
 		 1122 aa  231  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.79 
 
 		 1122 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.03 
 
 		 1155 aa  220  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.61 
 
 		 1227 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.38 
 
 		 1223 aa  194  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1014 aa  193  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.84 
 
 		 1148 aa  191  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  28.69 
 
 		 1323 aa  186  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  29.75 
 
 		 798 aa  182  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1169 aa  179  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1182 aa  176  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.63 
 
 		 1154 aa  175  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.36 
 
 		 1205 aa  174  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.85 
 
 		 1158 aa  172  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1169 aa  169  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  30.31 
 
 		 1545 aa  160  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  28.79 
 
 		 1214 aa  157  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  28.48 
 
 		 1215 aa  157  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  28.79 
 
 		 1225 aa  157  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  28.48 
 
 		 1228 aa  156  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.48 
 
 		 1181 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  43.94 
 
 		 1946 aa  149  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.94 
 
 		 1517 aa  148  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  27.5 
 
 		 991 aa  146  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  27.54 
 
 		 1327 aa  146  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.72 
 
 		 1500 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  28.01 
 
 		 1200 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  25.16 
 
 		 1361 aa  141  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  24.6 
 
 		 1127 aa  141  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  27.48 
 
 		 1254 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  27.56 
 
 		 1174 aa  137  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.35 
 
 		 1287 aa  134  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  27.34 
 
 		 1309 aa  133  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  26.8 
 
 		 1544 aa  126  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27 
 
 		 1245 aa  123  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25.19 
 
 		 1111 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  27.15 
 
 		 1378 aa  122  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  25.96 
 
 		 1069 aa  121  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  27.15 
 
 		 1378 aa  120  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  39.41 
 
 		 1895 aa  119  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  26.05 
 
 		 1067 aa  118  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  28.12 
 
 		 613 aa  112  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.06 
 
 		 1577 aa  110  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  28.77 
 
 		 1014 aa  110  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  27.27 
 
 		 1273 aa  110  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  24.28 
 
 		 1056 aa  80.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.06 
 
 		 1218 aa  74.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.52 
 
 		 1669 aa  72  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.75 
 
 		 1296 aa  69.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.96 
 
 		 1030 aa  67  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.28 
 
 		 1590 aa  66.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  23.26 
 
 		 1078 aa  62.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.26 
 
 		 1216 aa  62.4  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.77 
 
 		 1686 aa  61.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.35 
 
 		 1627 aa  62  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.33 
 
 		 1165 aa  61.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  23.09 
 
 		 1070 aa  61.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.66 
 
 		 1288 aa  60.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.44 
 
 		 1488 aa  60.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  24.28 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.4 
 
 		 1186 aa  57.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.88 
 
 		 1177 aa  56.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.01 
 
 		 1281 aa  56.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.75 
 
 		 1204 aa  56.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.75 
 
 		 1364 aa  55.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1255 aa  53.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2685  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein transmembrane  23.3 
 
 		 604 aa  52.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  23.45 
 
 		 1093 aa  51.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.68 
 
 		 1223 aa  50.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.47 
 
 		 1223 aa  50.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  22.35 
 
 		 1041 aa  48.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.98 
 
 		 1182 aa  47.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  24.91 
 
 		 596 aa  47.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.68 
 
 		 1482 aa  47  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.69 
 
 		 1299 aa  46.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.68 
 
 		 1168 aa  46.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.57 
 
 		 1168 aa  45.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.66 
 
 		 1191 aa  45.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.99 
 
 		 1201 aa  45.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>