45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2685 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2685  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein transmembrane  100 
 
 		 604 aa  1192    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  39.59 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  28.85 
 
 		 613 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.56 
 
 		 1158 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.62 
 
 		 1155 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  27.65 
 
 		 1378 aa  92.8  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  27.65 
 
 		 1378 aa  92.8  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  25.44 
 
 		 1323 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.43 
 
 		 1517 aa  84  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.25 
 
 		 1227 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1169 aa  81.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.32 
 
 		 1577 aa  81.6  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.36 
 
 		 1223 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  25.92 
 
 		 1581 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1169 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.76 
 
 		 1500 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.27 
 
 		 1181 aa  77  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  23.57 
 
 		 991 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1014 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  27.42 
 
 		 1273 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  28.66 
 
 		 1200 aa  70.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  25.82 
 
 		 1544 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1182 aa  67.4  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.25 
 
 		 1115 aa  67  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.37 
 
 		 1154 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  23.08 
 
 		 1470 aa  63.9  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  23.5 
 
 		 798 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  25.06 
 
 		 1493 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  23.53 
 
 		 1215 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  28.98 
 
 		 1228 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  28.98 
 
 		 1225 aa  58.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  28.98 
 
 		 1214 aa  58.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  24.31 
 
 		 1309 aa  57.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.24 
 
 		 1658 aa  57.4  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.4 
 
 		 1122 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.18 
 
 		 1205 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.99 
 
 		 1122 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  25.26 
 
 		 1521 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.3 
 
 		 1676 aa  53.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.24 
 
 		 1245 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  25.26 
 
 		 1521 aa  51.2  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  23.82 
 
 		 1111 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.22 
 
 		 1148 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.86 
 
 		 1717 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  22.19 
 
 		 1361 aa  44.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>