110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0490 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
1545 aa  3155    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.66 
 
 
1181 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.85 
 
 
1155 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.36 
 
 
1158 aa  331  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.72 
 
 
1223 aa  327  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  26.73 
 
 
1200 aa  301  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  32.73 
 
 
1115 aa  296  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.57 
 
 
1245 aa  293  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.36 
 
 
1227 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  28.6 
 
 
1014 aa  248  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.07 
 
 
1287 aa  245  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  30.27 
 
 
1470 aa  243  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  31.36 
 
 
1581 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.15 
 
 
1148 aa  241  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  26.25 
 
 
1254 aa  235  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  28.16 
 
 
1309 aa  234  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.03 
 
 
1122 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  29.7 
 
 
1521 aa  225  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  29.65 
 
 
1521 aa  225  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.03 
 
 
1122 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  26.22 
 
 
1544 aa  220  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  27.03 
 
 
1169 aa  215  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  28.54 
 
 
1327 aa  211  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  30.33 
 
 
1169 aa  210  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  26.69 
 
 
1182 aa  206  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.35 
 
 
1154 aa  204  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  29.73 
 
 
991 aa  196  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  32.89 
 
 
1323 aa  188  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  27.79 
 
 
1493 aa  185  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  30.6 
 
 
1174 aa  184  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  29.94 
 
 
1215 aa  183  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  29.94 
 
 
1228 aa  182  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  29.94 
 
 
1214 aa  179  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  29.94 
 
 
1225 aa  178  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  28.61 
 
 
798 aa  177  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.53 
 
 
1205 aa  173  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  27.82 
 
 
1067 aa  171  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  30.83 
 
 
1014 aa  171  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  28.99 
 
 
1273 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  26.01 
 
 
1069 aa  168  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.28 
 
 
1658 aa  163  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  35.97 
 
 
1123 aa  162  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.94 
 
 
1676 aa  160  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.17 
 
 
1500 aa  158  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.4 
 
 
1717 aa  157  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25.49 
 
 
1127 aa  143  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  26.96 
 
 
1111 aa  141  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  27.74 
 
 
1378 aa  141  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  27.74 
 
 
1378 aa  140  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.41 
 
 
1517 aa  135  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  27.31 
 
 
1361 aa  132  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.13 
 
 
1577 aa  123  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.42 
 
 
1030 aa  116  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  26.99 
 
 
613 aa  104  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.5 
 
 
1168 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.5 
 
 
1168 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.47 
 
 
1169 aa  103  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.29 
 
 
1218 aa  103  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.99 
 
 
3197 aa  102  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.83 
 
 
1168 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.94 
 
 
1355 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  35 
 
 
3197 aa  99  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  23.52 
 
 
1056 aa  97.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.78 
 
 
1168 aa  94.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.42 
 
 
1201 aa  94  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.06 
 
 
1168 aa  91.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.76 
 
 
1364 aa  89.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  26.9 
 
 
596 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  23.72 
 
 
1223 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.52 
 
 
1223 aa  85.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.52 
 
 
1223 aa  85.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.16 
 
 
1148 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.41 
 
 
1753 aa  82.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  27.41 
 
 
1743 aa  81.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.78 
 
 
1216 aa  78.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.21 
 
 
1186 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.63 
 
 
1212 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.68 
 
 
1190 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.25 
 
 
1296 aa  73.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.72 
 
 
1204 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25 
 
 
1288 aa  73.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.7 
 
 
1165 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  27.44 
 
 
1132 aa  72  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.33 
 
 
1182 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.3 
 
 
1281 aa  70.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.29 
 
 
1194 aa  69.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  25.88 
 
 
1078 aa  68.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.93 
 
 
1204 aa  67.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.66 
 
 
1191 aa  67.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3020  hypothetical protein  36.77 
 
 
543 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0806492  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  27.11 
 
 
1093 aa  67  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  27.93 
 
 
1070 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.31 
 
 
1177 aa  64.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  22.5 
 
 
1025 aa  60.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  26.91 
 
 
1255 aa  60.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  23.99 
 
 
1041 aa  60.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.47 
 
 
1488 aa  57.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6795  hypothetical protein  32.89 
 
 
1867 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.81 
 
 
1299 aa  55.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  22.73 
 
 
611 aa  55.5  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>