75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2835 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  50.05 
 
 		 1025 aa  939    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11870  type IV pilus assembly protein, PilY1-like protein  42.9 
 
 		 1036 aa  729    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  100 
 
 		 1041 aa  2128    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  34.74 
 
 		 1093 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  34.05 
 
 		 1070 aa  486  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  32.14 
 
 		 1102 aa  462  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  34.15 
 
 		 1078 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.35 
 
 		 1168 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.6 
 
 		 1168 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.53 
 
 		 1169 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.54 
 
 		 1168 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.43 
 
 		 1223 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.32 
 
 		 1168 aa  212  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.91 
 
 		 1194 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.1 
 
 		 1168 aa  212  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.85 
 
 		 1355 aa  211  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.9 
 
 		 1223 aa  211  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.43 
 
 		 1223 aa  208  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.94 
 
 		 1204 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1255 aa  202  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.18 
 
 		 1177 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1132 aa  197  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.66 
 
 		 1201 aa  193  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  27.31 
 
 		 1056 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.46 
 
 		 1190 aa  192  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.34 
 
 		 1186 aa  192  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  24.74 
 
 		 1364 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.34 
 
 		 1148 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.65 
 
 		 1216 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.9 
 
 		 1212 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.18 
 
 		 1191 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.82 
 
 		 1182 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.66 
 
 		 1165 aa  170  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  28.22 
 
 		 596 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.81 
 
 		 1030 aa  169  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.79 
 
 		 1204 aa  157  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1014 aa  96.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0237  pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  22.9 
 
 		 1251 aa  89.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.4 
 
 		 1122 aa  89  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.2 
 
 		 1122 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0266  putative pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  25.55 
 
 		 1324 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.388087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  26.65 
 
 		 1493 aa  82  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  25.61 
 
 		 991 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1169 aa  71.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.34 
 
 		 1544 aa  67.4  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.24 
 
 		 1245 aa  67.4  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1169 aa  64.3  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  25 
 
 		 1215 aa  62  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  25 
 
 		 1228 aa  61.6  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  23.06 
 
 		 1067 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  23.89 
 
 		 1545 aa  59.7  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  26.2 
 
 		 1309 aa  59.3  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  23.45 
 
 		 1069 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  23.53 
 
 		 1174 aa  58.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25 
 
 		 1158 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  23.58 
 
 		 1327 aa  58.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  24.79 
 
 		 1214 aa  58.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  24.79 
 
 		 1225 aa  58.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.03 
 
 		 1227 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.91 
 
 		 1155 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  21.85 
 
 		 1470 aa  53.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  26.09 
 
 		 1254 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.74 
 
 		 1500 aa  49.3  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  22.11 
 
 		 1581 aa  49.3  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  23.9 
 
 		 1200 aa  48.5  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.36 
 
 		 1517 aa  48.5  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  22.88 
 
 		 1127 aa  48.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.35 
 
 		 1676 aa  48.1  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  23.01 
 
 		 1323 aa  48.1  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  20.57 
 
 		 1895 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.46 
 
 		 1287 aa  46.2  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  21.21 
 
 		 1014 aa  45.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.82 
 
 		 1288 aa  45.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  23.08 
 
 		 1273 aa  45.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.31 
 
 		 1223 aa  45.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>