112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5194 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  54.35 
 
 
1158 aa  1249    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  46.42 
 
 
1227 aa  876    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  100 
 
 
1155 aa  2382    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  34.94 
 
 
1181 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  35.1 
 
 
1115 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.94 
 
 
1223 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.33 
 
 
1148 aa  412  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.63 
 
 
1287 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.91 
 
 
1154 aa  361  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  32.49 
 
 
1545 aa  351  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29 
 
 
1245 aa  348  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  35.81 
 
 
1493 aa  337  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  34.48 
 
 
1470 aa  335  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.03 
 
 
1205 aa  325  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  27.65 
 
 
1182 aa  323  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  28.74 
 
 
1200 aa  320  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  33.33 
 
 
1169 aa  304  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.06 
 
 
1122 aa  297  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  33.18 
 
 
1169 aa  296  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  33.85 
 
 
1581 aa  295  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.2 
 
 
1122 aa  295  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  30.73 
 
 
1309 aa  285  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  36.07 
 
 
1521 aa  263  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  26.99 
 
 
1014 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  36.07 
 
 
1521 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  33.03 
 
 
1323 aa  258  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  27.53 
 
 
1254 aa  253  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  26.85 
 
 
991 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  30.75 
 
 
1215 aa  231  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  32.74 
 
 
1214 aa  231  9e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  32.74 
 
 
1225 aa  230  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  32.42 
 
 
1228 aa  229  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.22 
 
 
1658 aa  225  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  27.37 
 
 
1014 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.03 
 
 
1676 aa  220  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  26.45 
 
 
1327 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  30.59 
 
 
1069 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  31.63 
 
 
1174 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.85 
 
 
1717 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  29.91 
 
 
1111 aa  209  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  30.07 
 
 
1067 aa  209  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  31.37 
 
 
1544 aa  209  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.87 
 
 
1500 aa  208  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.72 
 
 
1218 aa  204  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  31.91 
 
 
798 aa  202  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
1378 aa  192  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  29.44 
 
 
1378 aa  193  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.06 
 
 
1577 aa  191  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  28.31 
 
 
1127 aa  187  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  27.22 
 
 
1361 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  27.65 
 
 
1273 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.61 
 
 
1517 aa  172  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  29.75 
 
 
613 aa  112  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.84 
 
 
1299 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.18 
 
 
1223 aa  103  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.07 
 
 
1223 aa  102  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.27 
 
 
1488 aa  100  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2685  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein transmembrane  31.62 
 
 
604 aa  99.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687504  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.31 
 
 
1030 aa  99  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.11 
 
 
1201 aa  98.6  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.59 
 
 
1182 aa  98.6  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  23.07 
 
 
1212 aa  98.2  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.69 
 
 
1223 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  24.67 
 
 
596 aa  96.3  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  25.41 
 
 
1714 aa  95.5  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  29.66 
 
 
1132 aa  92.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.34 
 
 
1216 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.24 
 
 
1168 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.78 
 
 
1186 aa  89.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.15 
 
 
1056 aa  88.6  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.71 
 
 
1355 aa  88.6  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.21 
 
 
1168 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.21 
 
 
1168 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  24.37 
 
 
1895 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.91 
 
 
1190 aa  87  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.18 
 
 
1168 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  29.07 
 
 
611 aa  86.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  27.1 
 
 
1093 aa  85.5  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.42 
 
 
1169 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  25.9 
 
 
1123 aa  85.5  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.18 
 
 
1270 aa  85.1  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.24 
 
 
1191 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.82 
 
 
1568 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  21.53 
 
 
1255 aa  83.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  31.9 
 
 
1148 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  25.84 
 
 
1102 aa  82.4  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.11 
 
 
1168 aa  81.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.56 
 
 
1288 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.59 
 
 
1194 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.27 
 
 
1177 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  23.56 
 
 
1946 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.52 
 
 
1204 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  25.95 
 
 
1078 aa  75.1  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.9 
 
 
1590 aa  74.7  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  26.74 
 
 
1070 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.88 
 
 
1165 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.78 
 
 
1204 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.47 
 
 
1669 aa  73.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.73 
 
 
1686 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.25 
 
 
1364 aa  71.6  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>