90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2539 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  69.75 
 
 		 1154 aa  1664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  100 
 
 		 1205 aa  2475    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  46.44 
 
 		 1182 aa  934    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  42.84 
 
 		 798 aa  549  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  34.01 
 
 		 1148 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.42 
 
 		 1115 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.93 
 
 		 1155 aa  317  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.75 
 
 		 1158 aa  274  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.26 
 
 		 1227 aa  271  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.79 
 
 		 1122 aa  241  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.63 
 
 		 1122 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1169 aa  215  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.07 
 
 		 1223 aa  212  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  33.82 
 
 		 1581 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1169 aa  206  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  31.76 
 
 		 1521 aa  197  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  30.08 
 
 		 1521 aa  196  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.54 
 
 		 1181 aa  192  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.26 
 
 		 1245 aa  191  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  28.57 
 
 		 1470 aa  178  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.07 
 
 		 1287 aa  178  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.31 
 
 		 1676 aa  174  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  30.53 
 
 		 1545 aa  173  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 		 1378 aa  167  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  30.17 
 
 		 1323 aa  166  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 		 1378 aa  165  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.19 
 
 		 1717 aa  164  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  28.73 
 
 		 1127 aa  162  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  29.16 
 
 		 1215 aa  162  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  29.48 
 
 		 1214 aa  161  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  29.34 
 
 		 1228 aa  161  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  31.06 
 
 		 1225 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  28.48 
 
 		 1254 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25.78 
 
 		 1111 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  28.59 
 
 		 1493 aa  157  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.64 
 
 		 1658 aa  151  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.23 
 
 		 1517 aa  151  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1014 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  24.92 
 
 		 991 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  28.22 
 
 		 1014 aa  144  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  27.5 
 
 		 1174 aa  144  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.24 
 
 		 1500 aa  142  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  28 
 
 		 1327 aa  142  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  24.74 
 
 		 1309 aa  141  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  25.97 
 
 		 1544 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  25.33 
 
 		 1200 aa  137  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  25.81 
 
 		 1069 aa  129  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  27.23 
 
 		 1273 aa  127  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  25.42 
 
 		 1067 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28 
 
 		 1577 aa  111  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  26.88 
 
 		 1361 aa  97.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  27.94 
 
 		 613 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.92 
 
 		 1288 aa  73.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.57 
 
 		 1030 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.22 
 
 		 1488 aa  66.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  26.32 
 
 		 1946 aa  65.1  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.54 
 
 		 1223 aa  61.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.54 
 
 		 1223 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  23.23 
 
 		 1714 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.74 
 
 		 1216 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.7 
 
 		 1299 aa  59.7  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.57 
 
 		 1296 aa  60.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.96 
 
 		 1355 aa  59.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.42 
 
 		 1201 aa  57.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  22.72 
 
 		 611 aa  57  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  20.43 
 
 		 1177 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.56 
 
 		 1281 aa  55.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2685  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein transmembrane  23.18 
 
 		 604 aa  56.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  21.5 
 
 		 1223 aa  54.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.9 
 
 		 1168 aa  53.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.46 
 
 		 1590 aa  53.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1895 aa  52.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  24.26 
 
 		 596 aa  52  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.47 
 
 		 1168 aa  52  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.84 
 
 		 1218 aa  52  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.43 
 
 		 1568 aa  50.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.57 
 
 		 1056 aa  48.5  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.7 
 
 		 1627 aa  48.5  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.74 
 
 		 1723 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.51 
 
 		 1182 aa  47.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.9 
 
 		 1204 aa  47.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.32 
 
 		 1722 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.49 
 
 		 1191 aa  45.8  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.73 
 
 		 1212 aa  46.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.15 
 
 		 1666 aa  45.8  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.31 
 
 		 1168 aa  45.8  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.31 
 
 		 1168 aa  45.8  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0215  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.39 
 
 		 829 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.84 
 
 		 1168 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.26 
 
 		 1169 aa  44.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>