106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4843 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  53.14 
 
 
1067 aa  1044    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  53.41 
 
 
1069 aa  1036    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  100 
 
 
1014 aa  2025    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  30.48 
 
 
1014 aa  333  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  29.16 
 
 
991 aa  287  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.82 
 
 
1122 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.05 
 
 
1122 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.79 
 
 
1223 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  30.63 
 
 
1581 aa  243  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.51 
 
 
1181 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.44 
 
 
1155 aa  221  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  28.06 
 
 
1470 aa  218  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  25.7 
 
 
1174 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.56 
 
 
1227 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  29.04 
 
 
1521 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  29.04 
 
 
1521 aa  210  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  27.52 
 
 
1169 aa  209  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.67 
 
 
1245 aa  206  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  26.94 
 
 
1169 aa  205  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.8 
 
 
1158 aa  204  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  28.27 
 
 
1493 aa  194  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.48 
 
 
1115 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  28.51 
 
 
1214 aa  189  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  28.72 
 
 
1228 aa  188  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  28.85 
 
 
1225 aa  188  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  28.72 
 
 
1215 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 
1200 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  30.83 
 
 
1545 aa  180  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  29.09 
 
 
1544 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.41 
 
 
1287 aa  169  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  26.41 
 
 
1254 aa  161  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.79 
 
 
1148 aa  161  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  28.07 
 
 
1309 aa  158  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.4 
 
 
1205 aa  146  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.54 
 
 
1154 aa  145  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  25.33 
 
 
798 aa  135  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.22 
 
 
1030 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  26.76 
 
 
1327 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  29.1 
 
 
1111 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  24.61 
 
 
1182 aa  129  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.51 
 
 
1500 aa  126  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.99 
 
 
1218 aa  123  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  28.31 
 
 
1323 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.22 
 
 
1168 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.94 
 
 
1182 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.3 
 
 
1056 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  22.96 
 
 
1273 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.77 
 
 
1676 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.86 
 
 
1168 aa  110  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  24.18 
 
 
1378 aa  110  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  24.02 
 
 
1378 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.46 
 
 
1212 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.73 
 
 
1223 aa  106  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.81 
 
 
1168 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.79 
 
 
1169 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  21.81 
 
 
1168 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25.43 
 
 
1127 aa  104  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.04 
 
 
1658 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.32 
 
 
1191 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.02 
 
 
1168 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.16 
 
 
1517 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.7 
 
 
1717 aa  102  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.06 
 
 
1201 aa  102  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  24.22 
 
 
1361 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.32 
 
 
1186 aa  99.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.29 
 
 
1194 aa  99  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.02 
 
 
1177 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.57 
 
 
1577 aa  97.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.61 
 
 
1223 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.59 
 
 
1204 aa  95.5  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.28 
 
 
1190 aa  92.8  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.3 
 
 
1223 aa  91.7  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.13 
 
 
1148 aa  90.9  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.88 
 
 
1204 aa  89  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.18 
 
 
1627 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.63 
 
 
1165 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.31 
 
 
1488 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  24.44 
 
 
1132 aa  75.1  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.34 
 
 
1270 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.15 
 
 
1722 aa  71.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.16 
 
 
1669 aa  71.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.71 
 
 
1482 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.01 
 
 
1299 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.66 
 
 
1216 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  27.46 
 
 
596 aa  67.4  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.53 
 
 
1288 aa  67.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.6 
 
 
1723 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.01 
 
 
1590 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.08 
 
 
1686 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  21.89 
 
 
596 aa  65.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.47 
 
 
1722 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  23.53 
 
 
613 aa  64.7  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  23.12 
 
 
1895 aa  62.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  21.21 
 
 
1255 aa  60.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.33 
 
 
1296 aa  56.2  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.51 
 
 
1281 aa  54.7  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  22.92 
 
 
611 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  22.4 
 
 
1714 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.24 
 
 
1355 aa  52  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1082  hypothetical protein  22.99 
 
 
1137 aa  48.5  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>