86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0627 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  93.73 
 
 
1722 aa  3278    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  100 
 
 
1722 aa  3547    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.38 
 
 
1666 aa  1222    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  93.56 
 
 
1723 aa  3275    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  25.88 
 
 
1255 aa  85.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.3 
 
 
1686 aa  83.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  25.6 
 
 
991 aa  80.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  22.93 
 
 
1070 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.51 
 
 
1030 aa  76.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  25.34 
 
 
1014 aa  75.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.42 
 
 
1488 aa  73.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  29.22 
 
 
1581 aa  72  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.05 
 
 
1482 aa  71.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.33 
 
 
1299 aa  71.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  25.15 
 
 
1014 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.86 
 
 
1056 aa  69.3  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.06 
 
 
1296 aa  68.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  22.29 
 
 
1714 aa  68.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  23.86 
 
 
1078 aa  68.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  26.38 
 
 
1169 aa  67.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.91 
 
 
1168 aa  68.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.21 
 
 
1281 aa  67  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.13 
 
 
1669 aa  67  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.01 
 
 
1204 aa  65.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.05 
 
 
1627 aa  65.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.59 
 
 
1148 aa  64.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  30.95 
 
 
1378 aa  65.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  30.95 
 
 
1378 aa  65.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  25.48 
 
 
1069 aa  63.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.46 
 
 
1590 aa  63.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.65 
 
 
1181 aa  63.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.95 
 
 
1270 aa  63.2  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  27.05 
 
 
1169 aa  62.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  25.83 
 
 
1132 aa  62.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  25 
 
 
1093 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  24.39 
 
 
1067 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.62 
 
 
1288 aa  62  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.71 
 
 
1169 aa  60.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.71 
 
 
1168 aa  60.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.71 
 
 
1168 aa  61.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  24.84 
 
 
1493 aa  61.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.43 
 
 
1168 aa  60.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  27.1 
 
 
1309 aa  59.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.59 
 
 
1287 aa  60.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.02 
 
 
1155 aa  59.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.34 
 
 
1223 aa  58.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.41 
 
 
1946 aa  58.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.23 
 
 
1158 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.21 
 
 
1190 aa  58.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.79 
 
 
1223 aa  57  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.79 
 
 
1223 aa  56.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  28.22 
 
 
1895 aa  56.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  21.77 
 
 
1102 aa  56.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.44 
 
 
1245 aa  55.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.59 
 
 
1168 aa  55.5  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.22 
 
 
1115 aa  55.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  26.64 
 
 
1470 aa  54.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.65 
 
 
1517 aa  55.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.79 
 
 
1577 aa  53.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.81 
 
 
1500 aa  53.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  26.14 
 
 
1521 aa  53.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  26.14 
 
 
1521 aa  53.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.79 
 
 
1122 aa  52.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.79 
 
 
1122 aa  52.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.6 
 
 
1227 aa  52.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  27.73 
 
 
1254 aa  52.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  21.26 
 
 
1545 aa  51.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.47 
 
 
1148 aa  51.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.78 
 
 
1186 aa  51.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  24.57 
 
 
1182 aa  50.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  25 
 
 
596 aa  51.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.55 
 
 
1216 aa  49.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  27.18 
 
 
1228 aa  49.3  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  27.18 
 
 
1215 aa  49.3  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  27.18 
 
 
1214 aa  48.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  27.18 
 
 
1225 aa  48.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  29.14 
 
 
1273 aa  48.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11870  type IV pilus assembly protein, PilY1-like protein  28.57 
 
 
1036 aa  47.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.96 
 
 
1223 aa  47.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.99 
 
 
1212 aa  47  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.41 
 
 
1568 aa  46.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  24.32 
 
 
1174 aa  46.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.07 
 
 
1154 aa  45.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.26 
 
 
1355 aa  45.8  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  24.25 
 
 
596 aa  45.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  22.94 
 
 
1323 aa  45.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>