82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2675 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  100 
 
 		 1070 aa  2162    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  62.14 
 
 		 1102 aa  1381    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  71.33 
 
 		 1078 aa  1506    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  61.87 
 
 		 1093 aa  1289    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  34.05 
 
 		 1041 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  31.78 
 
 		 1025 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11870  type IV pilus assembly protein, PilY1-like protein  32.56 
 
 		 1036 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1132 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.44 
 
 		 1169 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.44 
 
 		 1168 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.44 
 
 		 1168 aa  239  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1255 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.38 
 
 		 1168 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.4 
 
 		 1168 aa  233  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.11 
 
 		 1168 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  28.8 
 
 		 1056 aa  227  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.97 
 
 		 1194 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.14 
 
 		 1223 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.05 
 
 		 1223 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.15 
 
 		 1186 aa  211  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.93 
 
 		 1223 aa  210  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.22 
 
 		 1148 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.41 
 
 		 1204 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.88 
 
 		 1201 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.85 
 
 		 1212 aa  195  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.15 
 
 		 1355 aa  194  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.73 
 
 		 1190 aa  194  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.56 
 
 		 1030 aa  188  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.65 
 
 		 1204 aa  184  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.92 
 
 		 1364 aa  181  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.13 
 
 		 1216 aa  178  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.47 
 
 		 1177 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.18 
 
 		 1165 aa  170  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.1 
 
 		 1191 aa  165  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  26.51 
 
 		 596 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.13 
 
 		 1182 aa  132  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1014 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  27.9 
 
 		 1273 aa  97.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0266  putative pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  26.49 
 
 		 1324 aa  95.9  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.388087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  25.34 
 
 		 991 aa  95.5  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0237  pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  23.91 
 
 		 1251 aa  84.7  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.81 
 
 		 1722 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  26.01 
 
 		 1228 aa  78.6  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.76 
 
 		 1158 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  26.01 
 
 		 1215 aa  78.6  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.1 
 
 		 1245 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  25.72 
 
 		 1225 aa  75.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  25.72 
 
 		 1214 aa  75.5  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.95 
 
 		 1723 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.49 
 
 		 1227 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.84 
 
 		 1722 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.74 
 
 		 1155 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.9 
 
 		 1122 aa  72.4  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.97 
 
 		 1544 aa  71.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  25.23 
 
 		 1378 aa  70.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  24.46 
 
 		 1378 aa  70.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.93 
 
 		 1666 aa  68.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.52 
 
 		 1287 aa  67.4  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.69 
 
 		 1122 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  25.3 
 
 		 1493 aa  66.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  27.93 
 
 		 1545 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.59 
 
 		 1577 aa  62.4  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  25.54 
 
 		 1470 aa  61.6  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.09 
 
 		 1676 aa  61.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.91 
 
 		 1500 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1169 aa  60.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  24.79 
 
 		 1200 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  24.31 
 
 		 1521 aa  58.9  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  23.31 
 
 		 1521 aa  58.9  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  26.23 
 
 		 1309 aa  58.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  25.15 
 
 		 1174 aa  57  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  25 
 
 		 1169 aa  57  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.85 
 
 		 1181 aa  55.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.32 
 
 		 1517 aa  54.7  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  24.59 
 
 		 1327 aa  54.7  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  21.9 
 
 		 1223 aa  52.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  22.47 
 
 		 1323 aa  49.3  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  22.02 
 
 		 1581 aa  48.5  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  26.24 
 
 		 1254 aa  47  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.4 
 
 		 1658 aa  47.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0215  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.56 
 
 		 829 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1048  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.25 
 
 		 1149 aa  46.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>