71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2038 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  46.77 
 
 		 1568 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.47 
 
 		 1627 aa  699    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  29.52 
 
 		 1946 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  44.46 
 
 		 1488 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  46.32 
 
 		 1669 aa  762    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  45.95 
 
 		 1482 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  45.95 
 
 		 1590 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  44.27 
 
 		 1299 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  46.84 
 
 		 1686 aa  792    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  100 
 
 		 1895 aa  3900    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  39.47 
 
 		 1470 aa  470  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  29.37 
 
 		 1521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  29.51 
 
 		 1521 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  28.27 
 
 		 1493 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  39.38 
 
 		 1581 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  26.55 
 
 		 1714 aa  342  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.52 
 
 		 1270 aa  255  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.63 
 
 		 1288 aa  189  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.35 
 
 		 1296 aa  188  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.57 
 
 		 1281 aa  187  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  26.43 
 
 		 991 aa  145  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.52 
 
 		 1658 aa  143  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1014 aa  133  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  25.89 
 
 		 1309 aa  123  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.31 
 
 		 1181 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  27.48 
 
 		 1544 aa  119  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.73 
 
 		 1676 aa  119  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.33 
 
 		 1717 aa  119  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.82 
 
 		 1245 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.21 
 
 		 1227 aa  100  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  25.61 
 
 		 1215 aa  99.8  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  25.39 
 
 		 1273 aa  99.8  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  25.61 
 
 		 1228 aa  99.4  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1169 aa  99.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  25.22 
 
 		 1214 aa  96.3  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  25.09 
 
 		 1225 aa  96.3  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.3 
 
 		 1122 aa  96.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.28 
 
 		 1122 aa  91.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1169 aa  90.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.43 
 
 		 1223 aa  89  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.37 
 
 		 1155 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.49 
 
 		 1158 aa  88.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.88 
 
 		 1500 aa  85.9  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  25.45 
 
 		 1254 aa  83.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  24.83 
 
 		 1200 aa  82.8  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.61 
 
 		 1148 aa  77.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  24.85 
 
 		 1327 aa  74.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 1378 aa  70.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 1378 aa  70.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.14 
 
 		 1115 aa  69.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  24.15 
 
 		 1174 aa  68.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1182 aa  65.9  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  24.12 
 
 		 1361 aa  65.9  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.91 
 
 		 1517 aa  65.9  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  28.51 
 
 		 1323 aa  65.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  23.12 
 
 		 1014 aa  62.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  30.34 
 
 		 1127 aa  60.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.1 
 
 		 1287 aa  57.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.79 
 
 		 1154 aa  57.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  28.22 
 
 		 1722 aa  55.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.68 
 
 		 1577 aa  55.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.45 
 
 		 1666 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  28.24 
 
 		 1382 aa  53.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.22 
 
 		 1722 aa  52.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.91 
 
 		 1205 aa  52.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.22 
 
 		 1723 aa  52.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.16 
 
 		 1030 aa  51.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  21.36 
 
 		 1041 aa  46.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  43.28 
 
 		 1545 aa  46.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  35.71 
 
 		 798 aa  45.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.72 
 
 		 1223 aa  45.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>