98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01324 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01324  PilY1  100 
 
 
1327 aa  2707    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  53.9 
 
 
1254 aa  1305    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  32.75 
 
 
1521 aa  322  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  33.54 
 
 
1521 aa  318  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  32.15 
 
 
1223 aa  294  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.51 
 
 
1181 aa  290  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.77 
 
 
1155 aa  230  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.01 
 
 
1227 aa  229  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.62 
 
 
1287 aa  223  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.34 
 
 
1158 aa  218  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  30.37 
 
 
1581 aa  217  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  28.42 
 
 
1545 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.91 
 
 
1245 aa  206  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.89 
 
 
1122 aa  201  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.04 
 
 
1122 aa  200  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  27.53 
 
 
1200 aa  199  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.75 
 
 
1115 aa  191  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  27.82 
 
 
1169 aa  179  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  30.15 
 
 
1014 aa  177  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  26.9 
 
 
1228 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  28.66 
 
 
1215 aa  177  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  26.9 
 
 
1225 aa  174  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  28.5 
 
 
1169 aa  173  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  28.53 
 
 
1214 aa  172  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  28.74 
 
 
1309 aa  168  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.35 
 
 
1148 aa  167  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.99 
 
 
1500 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  28.87 
 
 
1174 aa  165  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  32.04 
 
 
1470 aa  164  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.9 
 
 
1154 aa  160  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  27.62 
 
 
991 aa  153  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.84 
 
 
1676 aa  152  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  26.72 
 
 
1361 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.19 
 
 
1205 aa  148  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  30.63 
 
 
1493 aa  147  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  27.32 
 
 
1323 aa  145  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  33.49 
 
 
1111 aa  139  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.64 
 
 
1717 aa  137  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  27.79 
 
 
1273 aa  136  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  25.2 
 
 
1182 aa  135  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  26.03 
 
 
1378 aa  135  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  25.89 
 
 
1378 aa  134  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  27.18 
 
 
1014 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  30 
 
 
1127 aa  131  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  26.24 
 
 
1067 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  30.55 
 
 
1069 aa  126  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.94 
 
 
1658 aa  124  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.64 
 
 
1218 aa  122  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.56 
 
 
1517 aa  120  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  27.58 
 
 
798 aa  119  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  28.8 
 
 
1544 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.95 
 
 
1577 aa  98.2  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  25.4 
 
 
613 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.28 
 
 
1288 aa  94.7  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.32 
 
 
1627 aa  89  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.21 
 
 
1030 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.82 
 
 
1488 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.43 
 
 
1946 aa  76.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.12 
 
 
1299 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.76 
 
 
1590 aa  76.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.49 
 
 
1296 aa  76.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.6 
 
 
1669 aa  75.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.73 
 
 
1281 aa  74.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  27.66 
 
 
1123 aa  73.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.7 
 
 
1270 aa  70.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  25.05 
 
 
1093 aa  64.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  27.22 
 
 
1895 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  27.8 
 
 
1714 aa  61.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.56 
 
 
1686 aa  58.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  23.58 
 
 
1041 aa  58.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  26.03 
 
 
1132 aa  57  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  23.89 
 
 
1025 aa  57.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.71 
 
 
1568 aa  56.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  24.71 
 
 
1078 aa  55.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  24.59 
 
 
1070 aa  56.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.52 
 
 
1177 aa  55.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.4 
 
 
1148 aa  55.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  23.19 
 
 
1102 aa  54.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.37 
 
 
1204 aa  54.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  23.45 
 
 
1056 aa  53.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.52 
 
 
1168 aa  53.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.16 
 
 
1191 aa  52.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.62 
 
 
1186 aa  52.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.32 
 
 
1182 aa  52  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.95 
 
 
1168 aa  52  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  23.37 
 
 
1212 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  21.62 
 
 
1364 aa  50.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0266  putative pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  23.39 
 
 
1324 aa  48.9  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.388087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.66 
 
 
1216 aa  48.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.33 
 
 
1355 aa  48.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  24.16 
 
 
611 aa  47.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.94 
 
 
1168 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  25.91 
 
 
596 aa  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.94 
 
 
1168 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.64 
 
 
1165 aa  47.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.39 
 
 
1201 aa  47.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.81 
 
 
1482 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.16 
 
 
1169 aa  45.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>