69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2878 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  100 
 
 		 1025 aa  2108    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  50.05 
 
 		 1041 aa  931    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11870  type IV pilus assembly protein, PilY1-like protein  42.43 
 
 		 1036 aa  714    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  31.28 
 
 		 1093 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  32.01 
 
 		 1070 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  31.27 
 
 		 1102 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  31.59 
 
 		 1078 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.7 
 
 		 1168 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.44 
 
 		 1168 aa  224  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.71 
 
 		 1355 aa  222  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.44 
 
 		 1169 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.23 
 
 		 1168 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.71 
 
 		 1168 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.44 
 
 		 1204 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.16 
 
 		 1168 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.59 
 
 		 1223 aa  202  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.45 
 
 		 1186 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.21 
 
 		 1194 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.55 
 
 		 1223 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.8 
 
 		 1190 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.24 
 
 		 1223 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.82 
 
 		 1191 aa  193  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  26.01 
 
 		 1056 aa  193  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.37 
 
 		 1177 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.51 
 
 		 1212 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.95 
 
 		 1201 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.82 
 
 		 1364 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.87 
 
 		 1148 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.07 
 
 		 1216 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1255 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.12 
 
 		 1182 aa  169  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1132 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.44 
 
 		 1165 aa  164  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.76 
 
 		 1204 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  27.8 
 
 		 596 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.9 
 
 		 1030 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0266  putative pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  27.16 
 
 		 1324 aa  83.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.388087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0237  pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  23.58 
 
 		 1251 aa  82.8  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1014 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  23.43 
 
 		 991 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.83 
 
 		 1245 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.65 
 
 		 1122 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  25.88 
 
 		 1309 aa  64.3  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  23.49 
 
 		 1544 aa  64.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  22.75 
 
 		 1273 aa  62.4  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.62 
 
 		 1122 aa  62.4  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  23.79 
 
 		 1254 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  22.5 
 
 		 1545 aa  60.1  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  23.89 
 
 		 1327 aa  56.2  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  22.8 
 
 		 1493 aa  54.7  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.49 
 
 		 1115 aa  54.7  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  21.56 
 
 		 1200 aa  52.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.27 
 
 		 1227 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.74 
 
 		 1181 aa  51.2  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  23 
 
 		 1214 aa  50.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  21.43 
 
 		 1470 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  23 
 
 		 1225 aa  49.7  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  23.44 
 
 		 1581 aa  49.7  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  25.39 
 
 		 596 aa  48.5  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  24.26 
 
 		 1521 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  22.78 
 
 		 1228 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  22.38 
 
 		 1215 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  24.04 
 
 		 1521 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  21.71 
 
 		 1158 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  20.3 
 
 		 1069 aa  46.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.28 
 
 		 1155 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1169 aa  45.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1169 aa  44.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.84 
 
 		 1517 aa  44.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>