111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2668 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  100 
 
 
1743 aa  3558    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  96.39 
 
 
1753 aa  2988    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  36.1 
 
 
1157 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  35.27 
 
 
1172 aa  466  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  31.48 
 
 
1480 aa  333  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  31.48 
 
 
1461 aa  328  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  31.34 
 
 
1463 aa  314  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  29.47 
 
 
1409 aa  276  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  30.46 
 
 
1073 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  27.95 
 
 
1740 aa  206  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  25.97 
 
 
2418 aa  205  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  35.02 
 
 
809 aa  197  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  27.31 
 
 
1179 aa  190  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  40.82 
 
 
3197 aa  142  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  40.2 
 
 
3197 aa  132  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  28.66 
 
 
3794 aa  125  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  31.93 
 
 
913 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  22.85 
 
 
2864 aa  103  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3007  hypothetical protein  27.08 
 
 
503 aa  97.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3530  hypothetical protein  26.97 
 
 
549 aa  83.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 
690 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  24.31 
 
 
2652 aa  72  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  29.24 
 
 
1545 aa  71.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  28.08 
 
 
927 aa  68.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 
927 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.95 
 
 
1586 aa  67  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  26.82 
 
 
2513 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  27 
 
 
2510 aa  67  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.95 
 
 
1595 aa  66.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 
1917 aa  66.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  30.45 
 
 
628 aa  65.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  23.6 
 
 
2443 aa  63.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  29.49 
 
 
1517 aa  62.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 
3662 aa  62  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  27.03 
 
 
2843 aa  61.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.39 
 
 
1614 aa  62  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  32.58 
 
 
2942 aa  60.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.35 
 
 
1834 aa  59.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 
1840 aa  60.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.33 
 
 
1381 aa  59.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.13 
 
 
1942 aa  56.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.03 
 
 
482 aa  55.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  25.44 
 
 
2017 aa  55.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.9 
 
 
1976 aa  55.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.28 
 
 
1599 aa  55.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  23.17 
 
 
1763 aa  55.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 
474 aa  55.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 
955 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  33.9 
 
 
520 aa  53.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 
2401 aa  53.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  21.59 
 
 
3193 aa  53.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  58.7 
 
 
273 aa  52.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  35.29 
 
 
298 aa  52.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  35.29 
 
 
298 aa  52.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  21.83 
 
 
2479 aa  52.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  28.57 
 
 
942 aa  52.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.94 
 
 
1669 aa  52.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  25.39 
 
 
1053 aa  52.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.04 
 
 
2094 aa  52.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  28.93 
 
 
956 aa  52.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  33.88 
 
 
2554 aa  52.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  28.39 
 
 
886 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  21.37 
 
 
2145 aa  52  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  34.45 
 
 
316 aa  51.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  24.46 
 
 
1140 aa  50.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  28.17 
 
 
940 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 
2437 aa  50.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  23.39 
 
 
605 aa  50.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 
622 aa  50.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 
2374 aa  50.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  32.5 
 
 
2534 aa  50.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  24.32 
 
 
2413 aa  50.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3664  hypothetical protein  45.1 
 
 
302 aa  49.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  22.69 
 
 
3456 aa  49.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  24.1 
 
 
2283 aa  49.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.59 
 
 
788 aa  49.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.59 
 
 
788 aa  49.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  28.63 
 
 
881 aa  48.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 
2448 aa  48.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  22.74 
 
 
1710 aa  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25 
 
 
1572 aa  48.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  28.49 
 
 
893 aa  48.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.56 
 
 
1959 aa  48.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 
1600 aa  48.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  28.05 
 
 
2138 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  21.27 
 
 
1568 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  60.61 
 
 
1288 aa  48.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  31.36 
 
 
2494 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 
3333 aa  47.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  31.19 
 
 
2277 aa  47.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  23.6 
 
 
2762 aa  47.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  24.1 
 
 
722 aa  47.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  29.6 
 
 
554 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  24.06 
 
 
1957 aa  47  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.2 
 
 
1384 aa  47.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  28.07 
 
 
2658 aa  47.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.37 
 
 
2350 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  24.32 
 
 
1854 aa  46.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  22.91 
 
 
2165 aa  46.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  59.38 
 
 
1266 aa  46.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>